| 坂东千年王国论
山中直幸
第四章
源氏神话的创造
前九年之役
清和源氏的源赖义开始定居于坂东，他的领地是作为平直方的女婿，而得来的镰仓。当时坂东地区既不属于平氏也不属于藤原氏，而是由坂东各中小土豪所分割占据的，而作为后来者源氏已经没有插一脚的余地了。
那时候，在将门之乱爆发的同时，在出羽也发生了所谓的出羽之乱（939年），在平贞盛追讨狄坂丸叛乱（949年）以后，局势趋于平稳。朝廷也将武力镇压虾夷的政策转换为承认虾夷自治的怀柔路线。将北奥州交给安倍氏和清原氏分割统治。而以衣川栅为界的南陆奥则成为国司陆奥守所支配的领地。
作为相模守的源赖义于是便开始等待进入奥州的大好时机。随后，机会果真来了。
奥州六郡国司安倍赖良在当地自称酋长，不肯向中央缴纳赋税，拒绝服役，而且擅自跨过衣川栅扩大自己的势力。于是陆奥守藤原登任于永承六年（1051年）派遣出羽秋田城介平繁成为先锋攻打赖良，大败而回。
朝廷于是改命源赖义为陆奥守。但是源赖义并没有直接赴任，只是一直在老家做攻打奥州的准备。直到两年后，源赖义得到了陆奥守兼镇守府将军的任命，成为了名副其实的平定安倍赖良叛乱的人。
然而在前一年，由于朝廷大赦的关系，安倍赖良的谋反罪已经被抹消了。大赦令是藤原道长的女儿为了为上东门院祈求病愈而发出的。安倍赖良也因此得益，罪过被取消。
所以当陆奥守兼镇守府将军赖义前往赴任的时候，安倍赖良改名为赖时，以示恭顺之意，也就是表达了服从赖义的意思。而受大赦令，安倍赖良的领地也无条件恢复原状了，并没有否定他的奥六郡的自治支配权，这是赖义所不愿意看到的。
天喜四年（1056年）赖义的陆奥守任期满了，他由于还有镇守府将军的政务在身，于是返回镇守府所在的胆泽城和多贺城。在返回途中，路过阿久利川附近，收到了陆奥权守藤原说贞的儿子光贞·元贞的遇袭报告，袭击者是安倍氏。前九年之役就这么爆发了。
奥羽的秀乡流藤原氏
这一年，源赖义陆奥守任期到期后，继任的陆奥守是藤原良纲，良纲听说有战争，立即辞职不干了。朝廷只得继续将重任全部委托给赖义。
但是，源赖义打倒安倍氏的战斗的最初很不顺利，令自己陷入了苦战。
安倍氏的女婿藤原经清，人称亘理权守，是前陆奥国司的一员，在任期结束后成为了在地豪族。
而奥六郡的统帅安倍赖良，则在战役开始没有多久，就意外战死了。儿子贞任·宗任继承了他的位置，而事实上军事指挥是由女婿藤原经清所担任的。
藤原经清的父亲赖远，是藤原秀乡的子孙，经清本来是下总国的土豪。秀乡在击灭了平将门后因为这个大功而一举由六位升到了从四位下，担任武藏·下野两国守，历任镇守府将军。他的儿子千晴在中央供职，后来继承了担任相模权介而继承了秀乡的势力。在任期结束之前和前武藏权介平义盛起了纷争。而弟弟千常则在北坂东的国府衙门里发动了叛乱。这事被信浓国报告给了朝廷。
根据《藤原秀乡流系谱》，秀乡“始领为相州田原，号田原藤太。”在御伽草纸的《田原藤太物语》中也对秀乡“田原”的由来有过记载。
而清和源氏方面，源满仲历任武藏守·介，在他的同母弟弟满政·满季的担任武藏守的时候开始向坂东扩大势力。所以清和源氏和秀乡流藤原氏之间的对决仅仅是时间问题了。在忠常发生叛乱的第二年安和二年（968年）源满仲向朝廷告密，这就是所谓的安和之变。千晴·久赖父子被投入大牢，千晴被流放到隐岐国。之后，秀乡流藤原氏的宗主由藤原千常继承。而且自秀乡以来，秀乡流历代都是镇守府将军的候补，秀乡流藤原氏也没有停止在陆奥国的发展。在《今昔物语集》中，就有秀乡的孙子泽袴四郎和其余五将军和平维茂在陆奥国逐鹿的记载，而藤原氏的势力也延伸到了常陆·下野国。而在奥六郡安倍赖时一方的前陆奥国司藤原经清就是秀乡流的子孙。
秀乡流藤原氏和清和源氏之间有着奇妙的因缘。当年清河源氏之祖源经基赴任武藏守后发生了将门之乱，在经基逃回京都后，秀乡讨灭了将门。
而后，房总三国发生了平忠常之乱，赖义的父亲源赖信被任命为追讨使，将投降的平忠常带往京都。而成为下野国土著的是秀乡流的藤原兼光。平乱之后，房总的土豪一起向赖信进献了名簿行了臣从之礼。而下总国的藤原经清一族也是如此。
藤原经清乘赖义攻打的空隙时，亲自率领数百兵士跨越了衣川栅，四处征收财物。同时废弃了盖有国家朱印的赤符，而改之以盖私印的白符作为征税符。跨越衣川栅是对律令国家的明显侵略，而用私印代替官印更是对国家的一种侮辱。作为背负国家期望的源赖义而言，这是一种极大的屈辱。
天喜五年（1057年）在黄海之战中，追讨军大败，全军覆没。而且赖义的陆奥守任期又已结束了，康平五年（1061年），朝廷派遣高阶经重前往赴任。赖义深感屈辱，于是再次向朝廷上书请求收回辞令。
清原氏的援军
源赖义向出羽国山北的清原氏请求援军，在多次探访，好言抚慰和庄重的恳请以后，清原武则决定参战。联合军大部分都是由清原氏的军队构成。在编制的七军中，有六军是清原氏的军队，而赖义本队的主力则是清原武则的一族。
赖义军三千，清原军万余攻破了安倍贞任所据守的衣川栅，有一鼓作气攻破了鸟饲栅，包围了贞任最后的据点厨川。将打算突围的贞任活捉后斩首。而赖义面对被捕的藤原经清说：“汝这先祖相传的家奴！”随后用钝刀将他砍了数十刀后斩杀。这件事后来被记录在了《陆奥话记》里面。
前九年之役就这么结束了，论功行赏的结果，源赖义加封正四位下伊予守，儿子源义家为从五位下出羽守，清原武则加封为从五位上镇守府将军。因为朝廷认定清原武则为征讨安倍氏的第一功劳者，所以他继承了赖义原来的官位。
然而清原武则得到的不止这些。安倍赖时的女儿也就是藤原经清的妻子，带着她和经清之间的儿子清衡改嫁给了武则的儿子武贞。通过安倍赖时的女儿，清原武则得到了奥六郡的实际支配权。
当时年仅十九岁的源义家，不满足于从五位下出羽守的官位，并且时时刻刻落于就任镇守府将军的清原武则的下风。两年后，义家辞去了出羽守的官位。
于是陆奥国再次成为了清和源氏的宿怨之地。
后三年之役
前九年之役后二十年，永保三年（1083年）秋，源义家就任陆奥守。
在此之前，延久二年（1070年）发生了义家的祖父源赖信的弟弟赖亲的孙子陆奥守源赖俊，和散位藤原基通，发生交战，基通抢走了国守的印信的事件。而当时是下野守的源义家自己向朝廷申请向陆奥出兵，最后击败藤原基通，把他押到了京都。
与此同时在陆奥，清原氏也发生了内乱。当年清原武则援助源赖义剿灭了安倍贞任，于是出任了镇守府将军，支配了出羽山北三郡和安倍氏旧领奥六郡，后来儿子武贞·孙子真衡继承了领地。但是嫡流的真衡和异母兄弟，也就是安倍氏所生的清衡·家衡发生对立。这时候，源义家担任了陆奥守。
清原真衡的养子成衡，娶了义家和平宗干的女儿所生的女子为妻，和义家有了血缘关系，于是便向义家求援。义家终于迎来了介入清原氏内讧的机会。在真衡和清衡·家衡的战斗中，真衡突然病死，他的死使得养子成衡失去了争夺继承人的立场和资格，只得降服于清衡·家衡两人，义家也只好坐观两个人分配真衡的遗领。
这位清原真衡的养子成衡，在《清原系图》里面是平安忠的儿子，称作海道小太郎。安忠是平定将门之乱的平贞盛的弟弟繁盛的儿子，任出羽守。子孙是在岩城郡的海道氏。海道小太郎成衡也就是这一家族的人。那么缘何清原真衡会收别族的成衡作为养子呢？这就产生了一个疑问。
解开这个疑问的，是镰仓御家人和田氏的子孙移居越后国以后在中条家文书中所收录了《桓武平氏所流系图》。里面记载着帮助源赖义征讨安倍氏的清原武则，实际上自己就是平安忠的子孙。从平真人开始改姓清原。随后武则担任镇守府将军，弟弟则是在系图中没有记载的岩城三郎太夫贞衡。所以说，清原真衡的养子—来自岩城郡的海道小太郎并不是其他家族的人，而是自己的直系亲族。
但是随着成衡的养父真衡的死去，他失去了争夺的资格。不能够分配真衡的遗领，他只得前往处于义家势力范围下的下野国。
清原氏本姓平氏，接受了源赖义的邀请，凭借战功成为了镇守府将军。而赖义的妻子是平氏嫡流直方的女儿，生下了义家，而赖义·义家父子讨伐了奥六郡的安倍氏，换言之，其实是平氏的势力统一了出羽·陆奥国。无论是这个时期还是后来，对于源平两家而言，这都是很奇妙的关系。
八幡太郎的恐怖
应德三年（1086年）夏，家衡袭击了清衡的住所，杀死了他的妻子家眷，双方再次开始了武力冲突。家衡和清衡都是安倍氏的女儿，是同母兄弟。而家衡是清原氏，清衡是秀乡流藤原氏，双方的父系有所不同。义家在藤原家的清衡的哭诉下，率领数千人攻击清原家衡的据点出羽国沼栅。战斗持续了数个月，随着大雪季节的来到，义家军队冻死饿死者无数。
这件事情在京都成为了众人讨论的话题。义家通过弟弟义纲得到了情报，朝廷派出了停止战斗的官使，并想追究义家进行私斗的罪过。所以义家首先向朝廷报告清原氏对国家谋反，并申请讨伐的官符，得到了朝廷的认可。不过兵员和武器都要由他自费供给。
另一方，清原家衡放弃了沼栅，和叔父武衡一起退守坚固的金泽栅。义家陷入苦战，当时在京都担任左兵卫尉的弟弟新罗三郎源义光，听说这件事后，自主参战。源氏势力的扩张，义光立下了汗马功劳。得到了生力军的义家，在翌年宽治元年（1087）九月，率领数万军队包围了金泽栅。
这些兵士大都是从坂东动员的，对于这场金泽战争，后世流传了很多神话故事。都是一些赞颂自己祖先的传说。
然而现实中的金泽栅包围战并非如此。在这源氏的宿怨之地，成为了杀戮的地狱。义家展开了兵粮攻，将忍受不了寒冷和饥饿而逃出金泽栅的人不论男女老少全部杀死，金泽攻陷之后，义家没有答应武衡活命的请求将他斩首。将在攻城时破口大骂义家的武衡的手下千任用铁棒打掉牙齿，又割去了舌头。闯入金泽栅的义家军的士兵，对清原军的士兵进行了惨无人道的虐杀，一时金泽栅血流成河，尸横遍野，其景况惨不忍睹。另一方面，单身逃走的清原清衡后来改回了旧姓藤原，在平泉建立了自己的政权，打下了以后辉煌一时的平泉藤原的黄金文化的基础，不过这是后话了。
雄霸出羽山北地区一时的清原氏灭亡了。而义家自己在京都贵族中受到了“残杀无罪之人”的非难，同时也因为自己的暴行在民众中得到了“恐怖的八幡太郎”的称号。
院政的开端
源义家再度攻打奥州的后三年之役结束后，由于他事先没有得到朝廷的认可，这次战斗被认作是私战，因此得不到朝廷的恩赏。义家为了补偿那些跟随他的人，于是便动用私财进行恩赏。因为这个举动，源义家被参战的武士们公认为武家的栋梁，地方上的豪族们也向义家进献自己的庄园。甚至到后来连藤原摄关家这样的有力公家也向义家赠送庄园。
在后三年之役结束后四年，宽治五年（1091年），朝廷宣布禁止向义家进献庄园。翌年义家被禁止建立庄园。而发出这个禁令的是出于白河上皇的院政。
白河上皇的院政是在后三年之役的最后时刻开始的他是天皇的父亲，作为前代天皇退位后，他依然作为现天皇崛川天皇的监护人而掌握着实际的权力。而另一方面，作为天皇母亲方的藤原摄关家也掌握着实权。所以侍奉藤原摄关家的源氏也就自然而然的成为了白河院政要牵制的对象了。
但是虽然白河院手里掌握着权力，但是他没有可以支持这个权力的财力。而各地方豪族进献给义家的庄园越来越多，到白河上皇手里的庄园就越来越少。所以，如果牵制了源氏的发展，在源氏背后的藤原摄关家的权力基础就会大为削弱。因此白河院对源氏的任何一点过错都是不会沉默的。义家的儿子义亲被派到西国，他使用武力夺取了摄关家的庄园。被朝廷下令讨伐，结果最后被流放到了隐岐国。被内定为源氏家督继承者的义亲，就这么成为了白河上皇和藤原摄关家权力斗争的牺牲品。
频繁的熊野诣
当时，地方豪族随着自己的开发，私有领地逐渐大规模化，然后就可以逃避国司的课税。随着庄园的逐渐扩大，豪族的一族内部也分化出了庶流。这些庶流或分家有的也拥有着不弱于头领家的实力。
庶流或分家的抬头，白河上皇院政的确立，父系掌握权力是这一段时间社会的显著变化。自古以来实权都掌握在藤原摄关家的手中，这是从古代遗留下来的母系制度的遗迹，从平安时代的以来，一直是掌握一族人的一种手段。但是随着庶流的分立，“家”从“族”中独立出去，族长也逐渐开始向家长转变。
另一方面，自白河上皇开始，以后的天皇都会去熊野进行参拜活动。而天皇原来参拜的是处于伊势的供有天皇家氏神的伊势神宫，而从这以后改成了熊野参诣。白河上皇九次参拜，鸟羽上皇是二十一次，而后白河上皇是二十八次。两百年间一共举行了九十八次熊野参诣。
源氏的内乱
这个时候，源氏发生了一场内乱。
义家的还有两个同母兄弟，他们的母亲都是平直方的女儿。二弟贺茂次郎义纲，三弟新罗三郎义光。其中被称为八幡太郎的义家和石清水八幡社的渊源很深。而二弟义纲是在贺茂神社的神像前元服的。三弟义光是在大津三井寺（园城寺）境内的新罗明神的社坛前元服。三个人虽然是兄弟，但信仰的守护神都不同。
在义家攻打奥州的前九年之役和后三年之役之后，义家和下野国藤原秀乡嫡流的足利家纲的女儿所生的三子义国，与义家的同母兄弟义光和常陆平氏的大椽氏的吉田清干的女儿所生的，义业的孙子昌义之间展开了长时间的战斗。目的是为了代替长兄义亲的地位，继承源氏的家督。
结果，继承义家的是他的四子义忠，不过没有过多久他就被人暗杀了。当时凶手被怀疑是义家的二弟义纲。义纲被抓起来斩杀后，两个人的继承人是源为义和源义忠。而实际上，真正的主谋其实是义家的三弟新罗三郎义光。
当年义家兄弟在攻打奥州的时候，发挥了令人称羡的手足之情。而实际上，双方在暗地里为了源氏头领的位置争的你死我活。
坂东的义朝
源氏的内乱到了为义这一代后就基本告一段落了，在京都，为义被称作终生六条判官，意思也就是他一生都是检非违使。但是为义的野心并不止于此。传说他想要和全国六十六国的女人生下儿子，做当地的国主。而做父亲的为义则可以支配日本全国。不过根据历史学家的研究，在京都留守的为义自己恐怕没有什么时间做这样的事情，多半是他的孙子赖朝为了自己的政权而杜撰出来的。
为义和中央的中流贵族，刑部少辅藤原忠清的女儿，生下了儿子义朝。而外祖父忠清，在义朝出生之前就已经出家了。所以义朝无法得到母亲一系的庇护。被称作上总曹司的义朝幼年时，是在上总国长大的。继承的上总国的畔蒜庄（千叶县
君津市）是曾祖父赖义因为前九年之役的功劳而获得的领地。而安房国的丸御厨和武藏国的大河土御厨，也是源氏祖祖辈辈相传的领土。上总国也是曾经在房总三国掀起大规模叛乱的，平忠常的子孙上总氏所雄居的地盘。和上总国邻接的下总国是由同样是忠常子孙的千叶氏经常和上总氏为了相马郡的相马御厨（千叶县我孙子市）而征战不息。后来，到了康治二年（1143年）二十一岁的义朝受上总常重的邀请，介入纷争，夺取了千叶常重的相马御厨的所有权，降服了千叶氏。
翌年，义朝以坂东为据点，率领千余人，攻击了相模国镰仓的前哨大庭御厨。随从他的有，三浦、中村、和田氏等当地的武士团。而守备的一方，则是平良文的子孙，在后三年之役有勇将之名的，镰仓权五郎的后代大庭氏。义朝的嫡子源义平的母亲是三浦半岛上的豪族，三浦介义明的女儿，而和田氏是义明的嫡流。而在相模湾西海岸一带的势力中村庄司宗平的姐姐，则是义朝的乳母。
在京都了为义为了嫡子义朝所得的领地，而向伊势神宫和熊野大社进献了庄园，派遣自己的手下进行管理。在这里有一个例子要说一下，为义和熊野别当的女儿立田御前结婚，有了一个儿子和一个女儿。女儿就是丹鹤姬，凭借着这层关系，后来源义经在坛之浦合战中和平家交战时得到了熊野水军两百多艘战船，两千余人的援军。而那个儿子新宫十郎源行家，就是将以仁王打倒平氏的旨意带往坂东各源氏处的人。
恶源太义平
为义的嫡子义朝着手于整合组织南坂东的各武士团。这时候在京都，以西国为地盘的平清盛一族和在鸟羽上皇周围的中流贵族们开始崭露头角。清盛的手下在京都祗园社发生了殴斗事件，将在祗园社的延历寺的僧徒们押到了京都。为了阻止平氏在京都的武力活动，鸟羽上皇决心起用在坂东的义朝集团。
义朝将坂东的事务交给了嫡子义平，于久安三年（1147年）奉旨上京侍奉上皇。而数年后，义朝担任了从五位下下野守一职。侍奉藤原摄关家的为义大为震怒，没有想到自己的嫡子义朝竟然会侍奉藤原摄关家主要的政敌鸟羽上皇。
因此为义改立次子义贤为自己的后继者，派往北坂东。目的是为了控制下野守义朝的势力所达不到的上野国，和南坂东的源义平一较高下。义贤以上野国多胡郡（现群马县吉井町多胡）为根据地，展开了组织当地武士团的活动。
这时候在坂东的其他源氏还有：支配靠近奥州的常陆国北部一带的，新罗三郎义光的孙子，佐竹昌义。以及正和佐竹氏交战的，因为源氏的家督问题而展开私斗，失败后逃到利跟川东侧下野国足利庄的义国。
义国是义家的儿子，母亲是藤源秀乡流足利家纲的姐妹。义国是在后三年之役前生于下野国佐野庄内。依靠父系的威势而升任从五位下加贺介。义国长年和佐竹昌义在常陆国交战，被限制在了下野国内。随后，义国专心于开拓荒地，向鸟羽法皇的安乐寿院进献了庄园，立庄为足利庄，以次子义康为庄官。然后又渡过渡良濑川，来到上野国梁田郡，将梁田御厨进献给了伊势神宫。但是这个地方是他母系藤姓足利氏的势力地盘，争斗和诉讼自然也就是少不了的。
除了源氏以外，利根川西侧和武藏国北部的平良文流的秩父平氏也有同和当地小豪族的威势。他们的家督是在武藏国内很有实力的担任武藏国留守所总检校职的秩父次郎太夫重隆。但是他和嫡流的哥哥秩父太郎重弘不睦，又和利根川对面的下野国足利氏长年征战。
源为义的次子义贤从上野国多胡庄南下，凭借着自己是武藏国河越的秩父重隆的女婿，从比企郡的大藏馆出发，借助秩父氏的武力背景压制了上野·武藏国的武士团，势力日渐高涨。而重隆自己也借机拥戴作为源氏的贵胄的义贤和北上的义平对抗。
另一方面，相模国的源义平的叔母和三浦义明的女儿和秩父重弘的儿子重能结婚，秩父兄弟的分裂不可避免。同时，义平的父亲义朝和正妻尾张热田神宫的大宫司藤原范忠的妹妹由良御前生下了源赖朝。而范忠的女儿家给了上野国源义国的次子义康，义国的长子义重的女儿又嫁给了义平为妻。坂东源氏和源姓足利氏处于蜜月之中。
坂东的义平和义贤，正如在京都的为义和义朝一样，冲突不可避免。久寿二年（1155年）八月，相模的义平奇袭了武藏国的大藏馆，将义贤连同义贤的岳父秩父重隆一并剿灭，一举成名。当时义平不过才十五岁。这使得源为义的企图化为泡影。而义贤的次子和妻子从危机中逃脱，在乳母的夫家中原兼远的信浓国木曾谷长大，也就是后来的木曾义仲。而长子仲家则在京都的源赖政处成长，后来因为支持以仁王举兵而和赖政一起在宇治之战中战死。
为义一生的宿愿
在坂东的源义贤和秩父重隆被杀一年后，京都政界爆发了一分为二的保元之乱。鸟羽法皇死后，后白河天皇想要进行专制制度，而引起了退位的崇德上皇的不满，眼见父系院政又开始抬头，京都的各个势力开始分成了两派。
侍奉藤原摄关家的源为义跟从藤原赖长加入了崇德上皇一方，而侍奉鸟羽法皇的源义朝则根据法皇的遗言加入了后白河天皇一方。父子之间成为了敌人。义朝有儿子义平所组织的坂东武士团为后盾，而为义则无权无势。保元之乱的胜负实际上已经在前一年的坂东的战争后就已经决定了。
没有势力的上皇一方由文人藤原赖长所指挥，为义向儿子为朝献了夜袭之计却未获成功，为朝大怒之下将父亲斩首。然而，六十一岁高龄的六条判官，清和源氏的总帅，源为义，一生的宿愿就是能够获得自己的领地，这恐怕是斩了父亲的从五位下下野守源为朝所没有想到的吧。
为义在他武将生涯里唯一的愿望就是能够和祖父赖义，父亲义家一样，获得“陆奥守”的官位。朝廷认为为义如果获此官位太过危险而没有答应。而现在，源氏流传下来的宿愿只能够交付在为义的孙子源赖朝的身上了。这恐怕也是幼小的赖朝的宿命吧。
武者之世
对于保元之乱，慈元在《愚管抄》里这么说：“可称为日本国乱逆之事，以次，则入武者之世也。”这数次战争，发生在这狭小的平安京内，被京都的贵族们斥为“日本国的乱逆”，暴露了他们眼界的狭小。正式宣告了“武者之世”的来临。然而，与其把保元之乱说成是武家之间的战争，还不如说成是公家贵族的佣兵之间的战争。
象征着武者之世的到来的，还有死刑的复活。从九世纪以来，只有奈良时代药子之变时，藤原仲成被处以死刑，随后的三百五十年，一般的通例都是用流放来代替死刑。这是受佛教的影响。源义朝将父亲和幼小的弟弟处斩正式宣告了死刑的复活，而义朝政是武家的代表。因此公家贵族藤原信西惊恐的说，残忍的“武者之世”终于来到了。
后白河天皇和崇德上皇之间的争斗，以天皇一方的胜利而告终，自院政开始七十年以来首次恢复了天皇亲政。然而讽刺的是，三年后，后白河天皇退位。又重新开始了院政制度。和刚刚即位了二条天皇之间间隙日深，相互倾轧。这种倾轧最终导致了平治之乱的发生。通过平治之乱，源氏遭到了毁灭性的打击。支持天皇的源义朝带着残兵败将逃出京都，半路被背叛的部下所杀。源·平之间的对立由此展开。此后二十年，平氏依仗后白河院权倾朝野，并且加强了对源氏的压制。
平氏和后白河上皇的关系，就和藤原家一样，凭借外戚的地位，攀上权力的最高峰。作为佣兵身份进入权门的平氏开始青云直上。首先废掉了继承二条天皇的六条天皇，立平清盛的妻妹滋子受后白河上皇宠幸，所生的宪仁皇子为高仓天皇。作为天皇的大伯，又和上皇的关系良好，而清盛自己的女儿德子又作了高仓天皇的皇后，平氏的计划实现的很顺利。然而，以后白河上皇为中心的反平氏中心开始活动了。上皇方打倒平氏的谋划和清盛废除院政的计划，两者进行的斗争的结果，是发生了一场政变。政变的结果，就是由德子所生的年幼的安德天皇即位。
但是治承四年（1180年）四月，后白河上皇的第三皇子，也就是高仓上皇的异母兄以仁王，秘密的发出了讨伐平氏的密旨。以仁王是当初高仓天皇即位时有力的竞争者。他作为鸟羽上皇的皇女八条院的养子而长大。他不满安德天皇的即位，以“新皇”的名义向诸国散发密旨，承诺打倒平氏的战费由他供给。
然而以仁王的叛乱计划五月就曝光了。支持以仁王的摄津源氏的源赖政联合反平氏的延历寺和园城寺举兵，却被平氏打败。逃处的以仁王在宇治平等院被杀。先锋是侍奉平氏的藤姓足利氏。
藤姓足利氏
藤姓足利忠纲凭借着在宇治一战中的战功，要求得到自父亲俊纲以来就想得到的上野国大介一职和新田庄的土地。清盛很爽快的就发出了任命状。然而这一举动受到了一起参战的藤姓足利家庶流十六人的反对，并且向清盛申诉。于是清盛只得收回了大介的任命状。由此可见，在藤姓足利家里，家督对庶流的支配力是极端的低下的。
其实，庶流对本家家督保持着一定的独立性的并不仅限于藤姓足利一门，而是这个时代的特征。藤姓足利氏自身其实在藤原秀乡的子孙中就处于庶流的地位。秀乡流藤原氏是以下野国为中心，经过长时间的发展，子孙扩展到武藏、相模、下总、常陆诸国。宗家是武藏国太田庄的太田氏。在下野国还有庶流小山氏，小山氏世代世袭下野国权大介一职，和藤姓足利氏并称为“下野双虎”。
足利忠纲自父亲俊纲以来，就希望得到上野国大介的职位，以此来掌握各自分立的庶流。而他所想要的新田庄则是源氏的新田义重的本领地。
新田义重的父亲是源义国，是源义家在后三年之役前和藤姓足利家的女子所生的后代，自幼在藤姓足利家成长，父系是源氏，母系则是藤姓足利氏的庶流之一。后来新田义国·义重父子在藤姓足利的势力圈内独自开发土地，成立了庄园。两者长年陷入争执和诉讼之中。后来新田义重和源义平联手，源氏的色彩愈加鲜明，公开脱离了藤姓足利氏。足利忠纲想得到新田庄的土地，是为了要支配新田氏。然而这些计划都随着庶流们的反对而化成了泡影。于是藤姓足利氏和平氏之间的关系产生了裂痕。
源氏的叛乱
治承四年（1180年）八月，以仁王举兵三个月后，被流放到伊豆的源义朝的儿子源赖朝举起了反平氏的大旗，宣布举兵。
起初赖朝举兵讨平的反响并不怎么积极。当时坂东大部分都是平氏的知行国，知行国主可以自由任免国府的官员。而伊豆是摄津源氏赖政的知行国，在这里赖朝可以过着比较自由的流放生活。赖政在宇治川和以仁王被杀之后，伊豆的国主换成了平氏的人，在平氏的命令下，镰仓党之一的大庭一族率军和赖朝交战，赖朝被杀的大败而逃。
一败涂地的赖朝搭上了伊豆海贼土肥氏的船，本来想去相模国三浦半岛寻求三浦氏的支持，然而在强大的台风下，却被吹到了房总半岛的安房国州崎。
翌月，信浓木曾谷的源义仲举兵，将信浓一国置于自己的支配之下。同时，甲斐国的武田信义征服了甲斐国与信浓诹访地区。
赖朝在伊豆惨败之后，从房总招募士兵之后，再度向镰仓进发。而木曾的源义仲则数次进击上野国。义仲是长期盘踞上野国和源义朝·义平对抗，最后被偷袭住所战死的源义贤的次子，他这次进击上野国，目的是为了和在上野的父亲的旧部会合，两个月后，他返回了信州。
藤姓足利氏采取了对抗政策，将上野国府周围源氏方面的民居烧毁。而自己则后院起火，一部分庶流呼应义仲，投向了义仲一方。
相对于藤姓足利和平氏一路的政策，同为秀乡流的下野国的小山氏投向了赖朝一方。小山政光的妻子寒河尼是赖朝的乳母。赖朝的父亲义朝在保元之乱前是下野守，而小山氏是下野权大介，有这层关系在，所以选择小山氏做了嫡子赖朝的乳母。
寒河尼是出自二荒山座主宇都宫氏的八田宗纲。二荒山神社是在前九年之役，讨伐安倍氏的时候，当时的座主，藤原北家关白道兼的曾孙宗元东下，为了祈祷顺利平叛而留在了宇都宫，逐渐形成了一股神社和豪族合一的势力。二荒山神社和处于下野国的小山氏关系很深。赖朝举兵时，小山·宇都宫两家的家督和嫡子都被征招到京都为平氏服役去了，而寒河尼依然早早的派遣留守的部队前往赖朝处了。
常陆金砂城攻防战
十月，平家的坂东讨伐军抵达了，甲斐源氏的武田信义·安田义贞兄弟和赖朝联手，在骏河国的富士川，击败了平家的军队。此战过后，甲斐源氏被认定了战功第一，被任命为骏河·远江国守护。得知平氏军败北的消息的赖朝，立刻挥军西上，直扑京都。不光是坂东，全国都掀起了反平氏的狼烟。
但是，赖朝这次行军却受到了自举兵以来的诸多功臣和有力豪族的千野介常胤、上总介广常、三浦介义澄等人的反对。当初是流放罪犯的赖朝，如今成了“镰仓殿”，他们认为赖朝反平氏的行动不能太过分。得知平氏军在骏河败北的消息后，右大臣九条兼实在他的日记里记录到：“流放者源赖朝即将掀起当年平将门一般的叛乱。”赖朝作为坂东武者心目中担当反平氏旗手的具有高贵血统的人。他的天地不应该在京都，而是应该向将门一样建立一个坂东的独立王国。赖朝故而返回了镰仓，专心于加强巩固坂东地区。
下总国的千叶介常胤和上总国的上总介广常，同属于秩父平氏流，都是在房总三国掀起大规模叛乱的平忠常的子孙，他们时时刻刻受到邻国常陆北部的佐竹氏的进攻威胁。千叶氏原本继承了平将门遗留的相马御厨领地，曾和上总氏有过争执，在义朝的介入下得到了维持。但是在平治之乱义朝死后，领地被平氏方的国守藤原亲通没收，交给了常陆佐竹氏。所以千叶常胤在赖朝举兵之后，也公然杀死下总目代，发动叛乱。
上总氏则是在上总国有两万动员能力的大豪族，平治之乱后，上总介广常被平氏剥夺了上总权介的职位，他深恨平氏，于是加入了赖朝的队伍。
常陆的佐竹氏的父系是八幡太郎义家的同母弟弟新罗三郎义光的子孙。义光在五十岁左右被封为常陆介，前往赴任。常陆国豪族，当年讨灭平将门的平贞盛的子孙大掾氏前往国府出仕。义光娶了大掾氏的庶流吉田清干的女儿为妻。在久慈郡佐竹乡（常陆太田市佐竹町）建造住所。义光任期结束后，嫡孙昌义自命佐竹冠者，为了回避常陆南部的大掾氏的势力范围，转向领有了那珂川以北的奥七郡。在佐竹氏的北边，是秀乡流藤原氏的太田氏和天神林氏，他们有奥州藤原氏在身后做后盾。而佐竹氏获得相马御厨，是为了从常陆侵攻下总而走出的第一步。
当时，佐竹氏的家督佐竹隆义跟随平氏在京都，嫡子秀义留守金砂山城。十一月，赖朝进入常陆国府，常陆大掾多气义干加入他一方。赖朝在鹿岛神宫做了祈祷祈求胜利，随后对金砂山城发动了总攻击。山城的守备都是由佐竹秀义一族所掌管，但随着战斗的不利，在上总介广常的劝说下，城里投降的人越来越多，秀义无奈，只好放弃金砂山城，逃到了奥州境内靠近勿来关的花园城。赖朝没有多加追赶，仅仅是平定了常陆一国以后就退兵了。这为以后留下了祸根。
野木宫之战
鉴于坂东现在的状况，在十二月中旬，上野国清和源氏的新田义重来到了新落成的镰仓大藏御所，和宣称要成为坂东之主的赖朝会面。起初义重听说赖朝想向京都进军的消息后是想和平氏联手的，后来在听说这个消息不确切后没有轻举妄动。而在当初以仁王发出讨平的旨意后，新田义重和源赖朝、木曾义仲一样是自立行动的。他常常以八幡太郎义家的嫡孙而自负。然而，他逐渐无法募集到兵源了，而且自己的三子山名氏和嫡孙里见氏以及外甥源姓足利氏都已经早早的参加到了赖朝的军队中。他再自立下去也没有什么意义了。于是在赖朝举兵四个月后，他加入了赖朝的御家人队伍中，终于吃到了最后一口冷饭。
第二年治承五年（1181年）一月，年轻的高仓上皇病死。同年，返回京都的平清盛也死了。于是后白河上皇终于将政权重新掌握在了自己的手里。当年推翻院政，开数十年来天皇亲政的第一人，如今又重新恢复起了院政，不能不说是一种讽刺。
三月，跟从平氏在京都的佐竹氏家督佐竹隆义，任常陆介秘密潜回常陆，在召集了三千人后，从北陆道绕远路和中央的平氏密切联络，寻找得到追讨源氏的院宣的机会。
持有以仁王御旨，在熊野组织反平氏军队的源行家，率领三河·尾张的势力向京都迫近，也是在三月，于尾张·美浓交界的墨俣川附近和平家交战，大破之。
六月，深受平氏期待的越后豪族城氏攻入信浓，和木曾义仲·甲斐源氏联军在千曲川畔的横田河原交战，遭到惨败。这次战斗中，从上野国投降义仲的一部分藤姓足利氏也参加了战斗。木曾义仲则借着这次胜利，一举开始平定北陆的行动。
寿永二年（1183年）二月，常陆国的志田义广为了取代赖朝而举兵谋反，随从三万余人，闪电般的进军下野国。义广同属清和源氏，是木曾义仲的父亲义贤的弟弟。平治之乱时在霞之浦的南湖畔的信太庄。赖朝攻打佐竹氏时，曾和赖朝在国府见过面。他不甘心名为叔父而事事居于赖朝下风。于是志田义广和赖朝为了争夺源氏栋梁的位置而展开战斗。
下野的藤姓足利氏和志田义广军联手，一起的还有同为秀乡流的小山朝政。小山氏的家督政光正因为有守护皇宫的任务在身，所以朝政兵力不足，因此假装投靠志田方。但是小山氏是下野国的权大介，统率着国内的军事力量，所以最初他们是作为藤姓足利氏的庶流而被动员的。此时，赖朝的异母弟弟范赖也加入了军队。范赖一族的吉见赖纲是小山政光的幼子。
小山政光将志田义广军诱入了野木宫（栃木县下都贺郡野木町），借助地形的有利条件布阵，而将志田军击破。战斗中大将小山朝政中箭落马依然激战不止，朝政的弟弟宗政在从镰仓归还小山的途中，加入战斗将义广军击退。
藤姓足利忠纲见形势不妙，于是连忙向上野国撤退。家臣桐生氏背叛，断了忠纲的退路，忠纲无奈，只好逃往西国去依附平氏。而镰仓的赖朝为了彻底消灭藤姓足利，于是派兵前往足利攻打忠纲的父亲俊纲，俊纲被以前的家臣桐生氏杀死。和小山氏并称“一国双虎”的藤姓足利氏就此灭亡了。
义仲和赖朝
在野木宫之战中失败的志田义广，带着残兵脱离战场，从东山道前往信浓投靠木曾义仲。这必然使得义仲和赖朝的关系陷入恶化。这时候的义仲已经将越后·越前并入了自己的势力范围。他拥立以仁王的儿子北陆宫。但是上野国属于赖朝的势力范围，在信浓国又和甲斐源氏有利害冲突。可以说一个志田义广的加入并不会对形势产生决定性的影响。
那么赖朝和义仲之间产生不和的原因有很多种说法。一说甲斐源氏武田信光的女儿和义仲的嫡子婚约取消而产生恨意，而向赖朝进谗言说义仲想要和平氏联手讨伐赖朝。还有一种说法就是在东海地区活动的熊野的源行家，因为向赖朝求援未果而不满，于是和志田义广同样聚集在义仲的身边。
眼看着赖朝和义仲军的正面对决不可避免，但是，就在双方要诉诸武力的时候，却首先达成了和议。义仲的嫡子，十一岁的清水冠者义高作为人质前往镰仓，赖朝则预定将当时十岁的长女大姬许配给他。后来赖朝消灭了义仲之后，将清水冠者作为隐患而斩首了。
之后，木曾义仲的后患消除了，在两位叔父义广和行家的陪同下，以四万军队和平氏的十万军队在越中·加贺国境上的俱利伽罗谷展开夜战，平氏军队全军覆没。义仲则一鼓作气，以破竹之势攻上北陆道。
同时，在京都的佐竹隆义一直都没有等到赖朝有所举动而得到追讨赖朝的院宣，又眼看着一支支反赖朝的军队一个个失败，感叹之下，只得前往奥州藤原氏处寻求庇护了。
清和源氏世代的宿敌，奥州藤原氏的影子，现在开始隐隐约约的出现在了赖朝的面前。
赖朝变心
这个时期，赖朝是贯彻反平氏政权和反朝廷的立场的。证据就是他无视天皇所颁布的改元命令。当时，以仁王举兵和源氏崛起是在治承四年（1180年），第二年，朝廷宣布改元养和元年，翌年又改元寿永元年。但是源赖朝使用的年号依然是“治承”，在赖朝所出的书物公文中，可以看到治承五年、六年的年号——对于遵守不承认安德天皇的即位，自称“新皇”的以仁王的旨意的赖朝而言，这是当然的事情。
但是到了寿永二年（1183年）十月以后，赖朝的态度发生了一百八十度的转变。开始使用京都的“寿永”这个年号。在后白河上皇十月份宣旨以后，赖朝也开始了和朝廷的交涉活动。
在这之前的七月，木曾义仲、源行家、志田义广、甲斐源氏的安田义定以及摄津的多田源氏行纲从四面八方攻入京都。平氏一门放火烧毁了六波罗馆，带着六岁的安德天皇和三种神器逃走。这时候在延历寺的后白河上皇闪电般的回到了京都，并且开始了一系列的活动。他剥夺了平氏一门的官位，将平氏领地没收后分给了义仲·行家等人。在向他们发出追讨平氏的命令的同时为了牵制他们而向在镰仓的赖朝发出了上洛的指示。
赖朝狡猾的一面这个时候展露无遗。他以北有君临陆奥的藤原秀衡的威胁和畿内发生饥荒难以调派军粮为由，希望延期上洛。同时，他也得到了东海、东山、北陆三道全部国衙领地和庄园的支配权。在经历叛贼·恶徒·流放犯人的生涯后，从五位下前右兵卫佐源朝臣赖朝终于成功复活了。
这一年年末，自赖朝举兵以来的大功臣，大豪族之一上总介广常被忠实于赖朝的侍所副官梶原景时在轿子里刺杀。而广常正是反对和京都朝廷交涉而主张坂东独立的代表人物。
义仲败亡
后白河法皇十月的宣旨送到镰仓之后,赖朝立即调遣其弟义经带兵进京。他意识到与七月就入京并支配之的木曾义仲的对决将不可避免。而法皇宣旨的目的，不过是对义仲的挑衅而已。
另一方面，进军西国征讨平氏的义仲则陷入了苦战。在备中水岛一战中被杀的大败。此时赖朝控制了北陆道的传言四起，义仲便慌慌张张地返回了京都。北陆道本在义仲势力范围之内，法皇将其下赐给了赖朝，之前法皇还将东山、东海两道赐与毫无战功的赖朝，而全然不顾将平氏赶出京都的义仲。义仲大怒，遂与法皇失和。他率部袭击法皇御所法住寺、幽禁法皇，捕杀其近臣，甚至解除了摄政近卫基通以下近五十位公卿的官职。这可谓是空前的大动乱。义仲还同岳父——前关白藤原基房商量着，让小舅子藤原师家登上了摄政之位。接着，他又强迫法皇发出追讨赖朝、赐封自己为征夷大将军的宣旨——这一天，正是寿永三年正月初十日。
据《吾妻镜》记载，在伊势待机进攻的义经将义仲发动政变和当上征夷大将军的消息报给赖朝后，镰仓方面反应出强烈的羡慕——那也正是赖朝的心情吧。接到义经的报告后，赖朝立刻下令，命弟弟范赖率十万大军进京。
义仲就任征夷大将军之后，曾致信平氏，希望结为同盟：“恭候诸位进京，以共商讨伐东国之事。”，平氏方面却没有接受。征夷大将军的名分，确是以讨伐“东夷”赖朝之名赐给义仲的；但平氏一族到底是知耻的武士，接受死敌木曾义仲的劝说回京是至死不能雪的耻辱，所以才拒绝了结盟的请求。
于是，义仲想奉戴法皇西下北陆，却遭到拒绝；源行家反叛、志田义广亦已战死，多田行纲也成了敌人，元历元年（1184年）正月十一日，仅仅当了十天征夷大将军的义仲在近江国粟津（今天的大津市）与义经、范赖率领的关东军交战，于近江国粟津（大津市）战死。
粗野而善良的义仲还受到后来的俳人松尾芭蕉的喜爱。芭蕉从北陆路选择墓地到伊势,最后根据他的遗言,葬在了义仲寺,和义仲的墓背靠着背。
源氏之栋梁
另一方面，流落西国的平氏在供奉本族守护神的安艺国严岛神社徐徐恢复势力，压制了濑户内海，其主力部队进驻福原（今天的神户市）。源义经和源范赖于二月初进攻这里，这就是历史上有名的福原·一之谷会战。然而，大获全胜的源氏军队却因兵船和粮草的调配出现了问题而不得不停下了脚步，没有继续追击逃往屋岛的平氏。
三月末，由于追讨义仲有功，按照天庆之乱中剿灭朝敌平将门的藤原秀乡之先例给赖朝叙了正四位下的品阶；朝中议论纷纷，认为亦应按天庆之乱中征讨使藤原忠文被任命为征夷大将军的先例授予和义仲有亲戚关系的赖朝征夷大将军一职。但是，后白河发皇却提出了反对意见，他认为征夷大将军是在非常时期掌握军事大权的人，按照故例，应由天皇在京城亲自授予节刀后才能上任。然而，赖朝却是“身在镰仓”接受任命的特例。半步未出镰仓却被任为“征夷大将军”，这将意味着将出现在内天皇掌握大权，在外坂东离开京都而自立的分裂局面。
从赖朝的坂东独立政策就可以看出他存有二心，这其实不难判断。而后白河法皇不单纯的拘泥于故事前例的判决也是有他的正当性。然而，为什么在关东建立独立政权还要得到京都朝廷的认可呢？答案很简单。
镰仓殿赖朝个人不光身为坂东武士和御家人们的领袖，而且还是源氏一族的栋梁，但是并没有与之相应的直接实力。他为了要维持自己御家人首领和源氏栋梁的位置，就要依靠朝廷的权威。反平氏的源氏势力蜂拥而起之前的年代，从关东豪族的角度来考虑，这件事情就很容易理解了——豪族的家督只凭其家督的身份并不能支配一族成员；在得到国衙官员或庄园领主之类的职位后，在公权、领主的权威背景下才能开始指挥支配一族庶流。这，就是那个时代的特征。
赖朝也同样如此，毕竟能成为源氏栋梁的贵胄，并不仅仅是赖朝一人；更何况无论从作为武士的实力还是从能直接动员的兵力来看，赖朝一个人的力量都是微乎其微的。如果他那御家人之长、源氏之栋梁的身份得不到朝廷的权威认证，就很难维持自己的地位。
所以，兵力动员能力在坂东武士中一等一的上总介广常，也就因此被第一个开刀，成为了牺牲品。
甲斐源氏的肃清
可以威胁到赖朝源氏栋梁立场的那些人，木曾义仲被杀，志田义广战死，常陆佐竹氏逃亡。剩下可以和他对抗的，也就只有甲斐源氏了。和常陆佐竹氏一样，武田氏是八幡太郎义家的同母弟弟新罗三郎义光的子孙，也是源氏贵胄。所以他们一族一致团结动员起来的兵力，足以成为对抗赖朝最有力的势力。
当时，从属于赖朝的武田一门的坂垣兼信在攻打西国的军中。兼信是下任武田氏栋梁的有力候补，他也以自己正统源氏名门的血脉而自负。这给了赖朝以危险的警惕感。于是数年后，坂垣兼信因为在院领的地头职务上的不良举动而被流放到了隐岐岛。
在追讨木曾义仲的论功行赏一个月后的四月末，作为人质的义仲的嫡子义高从镰仓逃走了。五天后在武藏国入间河原（狭山市）击退了追击的部队。又四天后的五月一日，赖朝发出指令，前清水冠者义高的残党勾结甲斐、信浓两国谋反，于是派遣了很多的部队。
随后六月十六日，甲斐源氏武田信义的次子一条忠赖，也就是坂垣兼信的哥哥，在镰仓的兵营中、赖朝面前被杀死。但是，针对甲斐源氏的行动并没有结束。武田氏的周围被镰仓的大军团团围住，丝毫不敢动弹。赖朝的大军以追剿义高残党为名，四处抢掠。赖朝如此执拗的对待甲斐源氏，完全是出于一年前的对武田氏的不信任。
当年下野小山氏在野木宫之战中大破志田义广，当时在京都的中流贵族，赖朝的乳母的姐姐的丈夫三善康信，意外的得到了一个情报。那就是武田信义被任命为赖朝追讨使。赖朝急忙召信义前来质问，信义矢口否认，并且写下了誓书。但是从此赖朝就对甲斐源氏埋下了警戒的种子，于是下了肃清甲斐源氏的决心。之后，源赖朝一直都执拗的想要削减甲斐源氏的势力。
在一条忠赖被谋杀后的六月二十日，朝廷将三河·骏河·武藏三国给予了赖朝。且不论三河·武藏两国，单说骏河国，这里原本是在富士川之战后论功行赏给了武田信义的，朝廷这么做，明显是对甲斐源氏的削减。
义经逃亡
赖朝将三河·武藏·骏河三国的国司一职交给了弟弟范赖，而忽略了义经的存在。对于讨伐木曾义仲的时候和范赖一起立下战功的义经而言，多少也开始有所不满了。
后白河法皇看透了义经的这个心思。八月初，后白河法皇封义经为检非违使·左卫门少尉。九月，法皇又升任义经为五位下太夫判官。同月，赖朝再度命令范赖追剿西国的平氏。赖朝因为气愤义经自主接受朝廷的任官而将他留在了京都。而法皇则允许义经有上殿的权力。这是法皇为了引发义经和赖朝的正面对决而想出的计策，然而赖朝却不吃这一套，他反而将义经的妻子—武藏豪族河越赖重的女儿送到了京都，表示的对义经的信任。
起初范赖的进军很顺利，赖朝心里认为完全可以不起用义经。然而翌年战况逆转，赖朝无奈之下只得派遣义经出马。二月，义经冒着大暴雨强度屋岛，从背后奇袭平氏的大本营，同时又收编了熊野·伊予的水军。然后在三月二十四日长门坛之浦一战灭亡了平氏，此间距义经出阵仅仅四十天。
平氏灭亡之后，状况发生了急剧的变化。
赖朝对义经天才的战术能力大为惊叹。而且义经深受坂东各地武将的尊敬。这对身为源氏栋梁的赖朝自身构成了极大的威胁。但是义经自己丝毫没有意识到，当他护送着平氏的俘虏来到坂东的时候，却被禁止进入镰仓。赖朝在腰越的驿站留下了禁止义经进入了文书，义经写下了数篇申辩的信件，也就是历史上有名的《腰越状》。义经等了一个月也没有等到赖朝的回信，只好留下平氏的俘虏自己回京去了，回到了京都他才知道，自己的领地已经被全部没收了。
在京都的义经和当时在河内、和泉附近的源行家联起手来，得到了法皇的追讨赖朝的旨意后宣布举兵。就在宣旨前一天，赖朝秘密派出的暗杀义经的刺客土佐坊昌俊暗杀失败被捕。当宣旨的消息传到镰仓后，赖朝亲自来到了骏河国的黄濑川宿。这里正是五年前富士川之战前夕，赖朝和义经兄弟再会的地方。而今却成了攻打义经的指挥部。
义经挡不住赖朝的进攻，于是向西国败退以图再起。在摄津大物浦乘船出海的时候，遇到了风暴。船毁人伤，大多数军队都四散了，义经自己带着一少部分随从失踪了。
随着义经·行家的撤退，坂东军的先头部队进入了京都。事态的发展令法皇大为吃惊，慌忙派遣申辩的使者前往赖朝处，申明愿意引退。赖朝派遣岳父北条时政带着一千人上京交涉，提出了镰仓方面的要求。处于极端弱势位置的朝廷方面没有办法，只好全部接受。
赖朝所获得的，是日本全国的军事·警察权和日本全国总地头职位和各地的地头任免权。简而言之，赖朝得到了与“镰仓殿”这个身份相符的实力和权力。御家人“本领安堵·新恩给予”的范围向全国扩大。在朝廷人事方面，鉴于法皇的立场，将法皇周围的近臣全部放逐，代之以加入一些法皇批判派的公卿进行合议制。而支持赖朝的藤原兼实则被起用为天皇和镰仓之间的文书传递者。面对这些足以将反赖朝派一扫而空的要求，曾经方言引退的法皇虽然一百个不愿意，但也只得答应下来。实质上的镰仓幕府终于诞生了。
但是，拦在赖朝面前的，还有以奥州平泉为中心的藤原氏的势力范围。他先于坂东，形成了律令制度国家之外的奥羽独立国家。
同时，义经和行家的行踪被判明了。在大和吉野山抓住了义经的妾，白拍子静御前，从天王寺上陆的义经本人则装扮成苦行僧的样子前往大峰。
翌年文治二年（1186年）五月，行家在和泉被发现并迎来自己的死期。此前义经联合了比睿山延历寺和京都鞍马寺的僧兵，在法皇周围反赖朝势力的庇护下，寻求反击的机会。幕府方的到了消息，直接派兵踏进了拥有治外法权的大寺院。收到报告的义经很快就逃走了。而法皇在赖朝的恐吓下收回了对义经的保护，赖朝成功的孤立了义经。
血的祭典
义经在经过了多次的转移之后，出现在了奥州藤原秀衡处。翌年秋，日本列岛上不在赖朝控制之下的，也就只有奥州了。在鞍马山度过了幼年时代的义经，来到了奥州的秀衡处接受庇护。当年为了拥护兄长赖朝而举兵就是在奥州，而最后被兄长逼迫的又回到了奥州。
义经的不幸就在于他是一个战术上的天才以及战略上的白痴。战略是政治的延长，在战争中的政治也就是战略。
赖朝举兵以来，无论氏平氏还是法皇，都不止一次的向藤原秀衡发出过追讨源氏的催促和宣旨。现在秀衡终于坐不住了，面对法皇的使者，表面不动声色，暗暗的进行着对抗赖朝的准备。
但是，就在这一年的十月末，藤原秀衡病倒，很快就在平泉病死，他的遗体被放在了中尊寺金色堂的须弥坛下。临终之时，他向泰衡、国衡这两个异母兄弟指明了前进的路，他让他们两个互相书写了永不怀异心的文书，让他们侍奉义经为主君，团结一致共同对抗赖朝。但是遗言归遗言，在北方的王者藤原秀衡死后，陆奥王国开始显露瓦解的迹象了。
奥州是游离于律令王国以外的。因此赖朝做了两手准备，一方面从朝廷那里讨来了要求逮捕义经的院宣；而另一方面，又向奥州方面许下交出义经的优厚条件。这两手轻易的就迷惑了秀衡死后接替他的位置的藤原泰衡。于是中了计的泰衡突然袭击了义经所在的衣川馆。义经在持佛堂杀死妻子后自杀。这位义经之妻正是当年赖朝下令送往京都的河越重赖的女儿，时年二十二岁，他们的女儿才仅仅四岁。义经死时三十一岁，他的首级被浸泡在美酒中送到了镰仓。
杀死义经并没有给陆奥王国带来平安和利益，泰衡的判断过于天真了。在赖朝眼里，义经所犯的罪过并不是他自己的事情，幕后肯定有主谋。于是向朝廷讨要讨伐泰衡的旨意，然而在义经已经死了的现在，要到这种旨意对于赖朝来说恐怕也就没有以前那么容易了。而坂东武士反复多变的本性，在这个时候暴露无遗。
文治五年（1189年）六月，赖朝决意平定平泉，于是向天下诸国发出了总动员令召集军队。但是朝廷的敕令迟迟未下。这时候，镰仓权五郎的曾孙、熟悉兵法典故的老将大庭景能对赖朝说：“将军在外，天子之令有所不受。”
这时候，赖朝担负的是全体坂东武士的利益，当年以仁王高仓宫发出征讨平氏的旨意，赖朝的讨伐平氏的战争也是凭借着天皇·亲王旨意行事的“公战”。而这一次，则是在天皇旨意之外的“私战”。为了对付源氏祖祖辈辈的宿敌奥州藤原氏，赖朝动员了全国总共二十八万四千人的军队，这可以说是前无古人的空前的大军事行动。
赖朝亲自挂帅，大军轻易的突破了白河关，一直北上，在阿津贺志山击破了以藤原国衡为首的藤原军的主力，并且一鼓作气拿下了首都平泉，藤原泰衡仓皇北逃。奥州藤原氏四代以来建筑的富贵荣华毁于一旦。
战斗结束了，但是赖朝的追击并没有终止。
赖朝从平泉继续北上，直指厨河栅。他的祖辈源赖义讨伐安倍氏的时候，花费九年时间，最终就是在厨河栅取得了安倍贞任的头。这里是先祖赖义的到最后胜利的地方，对于源氏而言是最大的福地。赖朝的平泉战争好比是一百年前的前九年之役的延续，赖朝好比是赖义的化身，而泰衡就是失败的贞任。
泰衡在北逃的途中，在家臣的住所遭到突然的叛变，横死当场。他的首级被送到了赖朝的营地。按照征讨安倍氏的古例，赖朝下令将泰衡的头挂起来示众。执行者是武藏七党中横山党的横山野太夫经兼的曾孙时广和儿子时兼，他们将泰衡的头用八寸长的铁钉高高钉起。宣布着源氏要用血来复仇。这是赖朝早就计划好的仪式，被鲜血染红的厨河栅，再次成为了这血的祭典的拜祭场。
奥州独立国家终于毁灭了，而相对的，一个坂东独立王国建立了起来了。
第五章
源氏三代灭亡
热田大宫司家
源赖朝是尾张国热田神宫的神主、大宫司家的三女儿，由良御前和父亲源义朝所生的第三子。他的长兄是由相模国三浦半岛上的豪族，三浦介义明的女儿所生的镰仓“恶源太”义平，他在坂东纵横驱驰勇名卓著，然而终生无官无位，就这么着在平治之乱中死了。
次兄朝长是义朝和自称藤原秀乡的子孙的相模的波多野远义的女儿所生。凭借着和波多野氏的关系，他进入了崇德天皇的藏人所，担任了从五位下的左兵卫尉，后来升任宫司除目的少进职。
相比之下，源赖朝所处的地位并不高，然而却保持着义朝嫡子的地位，这完全是凭借着他母亲所处的热田大宫司家在中央政界的实力。
源义朝的母亲是刑部少辅藤原忠清的女儿，他们一族和鸟羽皇女统子内亲王（上西门院）以及他母亲待贤门院璋子（鸟羽中宫）关系密切。另一方面，热田大宫司家这一族人无论男女在鸟羽院身边的人很多，而义朝就是这家的女婿。
赖朝的母亲由良御前的兄弟范忠和范雅是后白河院的近侍，姐妹是待贤门院和上西门院的侍女。她的父亲，也就是赖朝的祖父大宫司藤原季范和鸟羽院的乳母悦子是亲属关系。所以由良御前可能也是上西门院的侍女。而且热田社领也是上西门院的本家，是在她的保护之下的。
作为源为义的嫡子，一生侍奉藤原摄关家而没有受到过任何领地册封的源义朝继续在坂东进行秘密的活动。在仁平三年（1153年）破格受封从五位下下野守。随后，由大宫司家的女儿所生的源赖朝，在保元三年（1158年）统子内亲王被封为皇后的时候，以12岁的年龄担任了皇后宫权少进。翌年又兼任左兵卫尉。统子称上西门院时，他又担任了女院厅藏人·
内藏人侍奉二条天皇。
平治元年（1159年）十二月，当平治之乱时义朝和藤原信赖压制庙堂的时候。年今13岁的赖朝升任兵卫府次官、右左兵卫权佐。小小年纪就能得到这样高的官位，将来，正三位以上公卿的位置就基本上是预定了的。
那么在中央政界这么有实力的热田大宫司家到底是什么人呢？
当时大宫司家起源是藤原氏，在赖朝母亲的祖父一代称为尾张氏。他们的祖先是尾张国造,大和律令的时候所有各国的国造都被废黜了，而以国司取代国造的统治，所以尾张国造实力衰落以后改称为尾张氏了。
后来尾张氏由藤原氏取代，藤原南家的季兼做了尾张员职的养子。后来又以婿养子的身份继承了大宫司一职。而原先尾张大宫司家的子孙则做了第二位的权宫司。后来逐渐又吸取了赴任国司的血统而流传下来。
之后，在将尾张国造的历史向前翻。大和葛城山的高尾张移居到了尾张国，开始和当地的土豪相融合。那些建造了在浓尾平原南部，面朝伊势湾的断夫山古坟就是尾张国造的祖先。随后，尾张的稻种命参加了日本武命的东国征伐。回来后伊势的倭媛将草薙剑送给了尾张的宮簀媛。从此以后，热田神社就成为了祭祀草薙剑的尾张氏的氏社了。
草薙剑是守护天皇皇权的神剑。和神镜、勾玉一起成为了象征天皇皇权的神器。换言之，草薙剑就象征着天皇的武力。这些神器也随着平氏的没落而沉于大海。虽然神镜和勾玉被奇迹般的抢救了回来，但是神剑却永沉海底了。这也就意味着守护天皇皇权的武力消失了，皇权成为了一种赤裸裸的存在。
而赖朝作为热田大宫司家女儿的后代，自然而然的成为了失落的神剑的代理人。这些解释都是来源于藤原兼实的弟弟慈园的《愚管抄》里。代替了守护皇权的草薙剑，赖朝的肉体化做了神剑。这种解释是很合理了，赖朝也是这么期待的。
而京都朝廷一方面的解释则是，赖朝是在坂东代表朝廷皇权的代理人，他击败了诸多敌手，成为了坂东的“王”。为了安抚坂东的武者们，要把这种王的制度永远延续下去。
征夷大将军
在奥州攻略三年后的建久三年（1192年）三月，后白河法皇驾崩，与此同时，源赖朝就任征夷大将军的报告也抵达了镰仓。在法皇活着的时候，赖朝没有能够得到征夷大将军一职。在法皇驾崩的同时，在亲赖朝派的关白藤原九条兼实的斡旋下，赖朝成功的得到了这一职位。
在一年的丧期结束以后，赖朝在各地展开了盛大的狩猎活动，这并不是一种游乐活动，而是一种军事演习，是一种炫耀武力的活动。
自镰仓幕府成立以来，各地的叛乱和冲突就从没有间断过。这一年的正月，相模三浦氏的首领三浦义澄有不臣的举动。此前，在赖朝举兵讨伐平氏的时候，三浦义澄就继承了战死的父亲义明的地位，导致了相模各地一族的内乱。使得赖朝加深了对三浦一族的警惕。
二月，北武藏国的秩父平氏流的武士团，位列武藏七党的丹·儿玉两党之间发生了激励的冲突，形式一触即发。赖朝命令秩父平氏的偬领畠山重忠前往制止。
就在狩猎活动开始前的三月，赖朝得到了平氏的残党越中守盛嗣在周围潜伏的消息，于是发出了追讨命令。
在这种不稳定的形势下，赖朝认为进行地方视察是非常重要的。所以亲自率领军队进行狩猎活动。三月末在下野国的那须野，四月初在信浓国的三原。然后暂时返回镰仓。五月的时候富士的裾野展开了大规模的狩猎活动。这里成为了赖朝的嫡子源赖家作为未来的第二代镰仓将军的舞台。从此坂东“王”的制度就这么踏出了实行的第一步。
同时，一件事情也在裾野发生了。
这件事也就是在那个时代很轰动的“曾我兄弟复仇事件”。这是历史上三大复仇事件之一。在安元二年（1176年），也就是赖朝举兵前四年，伊豆的豪族工藤氏的嫡流和庶流后代之间发生了领土争端，后来被赖朝剿灭后遗留的兄弟二人在狩猎现场进行复仇，哥哥当场被杀，弟弟被捕后斩首。
对于这个事件，过程很简单。但是事因久很值得探讨了。由一种说法，说曾我兄弟的末后黑手是北条时政。这是他借曾我兄弟复仇的机会乘机暗杀源赖朝的阴谋。事件的舞台富士野是骏河国守护时政的辖地。曾我家弟弟五郎和他是乌帽子亲。虽然赖朝现在成了将军，但是时政依然不喜欢这个浪人出身的女婿。因此他暗地里指使曾我兄弟暗杀赖朝。
针对北条时政黑幕说，还有另一种说法，也就是范赖说。当时赖朝和范赖兄弟之间有一种微妙的对立关系，如果范赖杀了时政和赖朝以后，镰仓的大庭景义·冈崎义实会呼应起兵。这种说法的根据就是在事件以后，范赖一党很快被肃清，大庭和冈崎两个人出家。
而目前史学界比较倾向于永井孝一的北条时政黑幕说。
肃清的风暴
源氏栋梁的争夺战逐渐趋于激烈，对外的征战基本上已经都结束了。而暗杀征夷大将军赖朝的征兆则在镰仓幕府的内部出现了。面对这种权利斗争的形式，源赖朝逐渐走上了肃清风暴席卷的专制的道路。
常陆的多气义干在赖朝军的千叶常胤和上总广常攻击常陆南部佐竹氏的时候献出了常陆国府而保持中立。后来成为了镰仓的御家人。在裾野狩猎前夕，多气义干因为常陆鹿岛社的年贡问题而耽误了行宫的建造，因而受到了奉行的斥责，邻国的八田知家就是奉行之一。
随后就是裾野骚动，八田知家邀请多气义干去裾野，但被拒绝。多气义干据守多气山城。八田知家向赖朝报告说多气义干有谋反的野心。于是赖朝令义干和知家当面对质。结果八田知家凭借出色的口才说的义干无言以对。结果义干被没收领地，流放到了骏河。其实这是赖朝和他乳母的儿子八田知家联手设下的圈套，为的是削弱常陆大掾氏的势力。
源赖朝的异母兄弟三河守源范赖出生于远江国的蒲生御厨，母亲是当地池田宿的游女。父亲义朝在平治之乱中被杀，机缘巧合之下，范赖成了京都中流贵族藤原范季的养子。藤原季范是后白河院的近臣，同时，他也是右大臣藤原兼实的管家。作为养子的范赖，必然也就成为了哥哥赖朝和朝廷打交道的窗口。木曾义仲追讨平氏的时候，范赖补任三河守，和源义经作为追讨军的大将率领数万士兵前往京都。随着义经的倒台，范赖所有事情都仪仗赖朝的指示，很慎重的进行自己的行动。然而随着富士裾野事件的发生，范赖也逃不过肃清的风暴。
富士裾野事件报告到了镰仓，却误报成赖朝被杀。留守的范赖对政子说：“以后有我在你就放心吧。”八月，传来范赖谋反的消息，范赖在赖朝的命令下，前往伊豆修善寺。
有这个消息的起因是因为范赖的养父藤原范季暗中援助潜伏中的义经，被赖朝上书解除了官职。于是赖朝就怀疑范赖是否和义经有联系。
这时候发生了一件对范赖很不利的事件，范赖的家人当麻太郎偷偷潜入了赖朝的住处被抓住。他辩解说他是为了探明赖朝的真正心意，而不是刺客。赖朝则乘机以此为借口，攻打范赖家人所在的滨宿馆，要谋杀伊豆的范赖。
范赖的妻子是安达盛长的女儿，而盛长的妻子丹后内侍和赖朝乳母比企氏有亲戚关系。而赖朝的乳母丈夫家小山氏和范赖又是姻亲关系，所以在范赖倒台时他们都害怕受到牵连而没有动弹。于是，范赖和他六岁的嫡子一起自杀，而他另外两个儿子在丹后内侍的求情下活了下来。
但是赖朝的专制肃清并没有结束。
这一年的十一月，甲斐武田一族的安田义定的嫡子越后守义资因为向赖朝身边的女官发情书，而被投进了大牢。虽然武田氏受到了赖朝毁灭性的打击，但是依然担任了和平氏势力圈相连接的远江国守护，这足见安田义定的实力。赖朝岂会放过这个再次打压武田氏的机会，翌年八月，安田义定被控谋反而被斩首。
大庭景义和冈崎义实的出家，则是在范赖倒台之后的事了。景义是在攻打奥州藤原氏的时候，在朝廷下敕命的时候，放言说：“军中唯听将军之命，而不听天子之诏。”的豪迈之士。他的出家到底是因为发生暗杀赖朝而引咎，还是单单的对范赖的倒台的抗议行动，已经无法判断了。
这个大庭景义后来又重新成为了镰仓御家人，这是两年以后的建久六年（1195年）的事情了。这时候赖朝正在进行第二次上洛的计划，上洛的时候景义被授予在赖朝的牛车前开道的莫大荣誉，这是赖朝显示自己对老臣也有重视的一面。
赖朝之死
赖朝第二次上洛的时候，首先将被平氏烧毁的奈良东大寺重建了起来，并和妻、子结伴进行了祭祀。而他本来的目的，则是想仿效藤原摄关家和平清盛，将女儿大姬嫁给后鸟羽天皇。这是在上洛和后白河法皇和解之后的计划，然而这个计划随着法皇的驾崩和大姬的患病而暂时搁置了下来。
此时，作为京都里亲赖朝派的第一人的摄政藤原兼实此时将女儿任子献进了宫里，要和赖朝来争夺天皇外戚的地位。于是赖朝和兼实最终决裂，转而接近故法皇所宠爱的丹后局与宣阳门院别当源通亲，策划大姬入宫的计划。与兼实的决裂和失去了弟弟范赖这个和京都打交道的窗口，赖朝也没有别的办法可想了。
赖朝在强行推进镰仓专制，得到了征夷大将军的地位之后。虽然成了镰仓御家人的首领，但他依然期待着更高的地位，如果大姬能够顺利入宫的话，他凭借天皇外戚的身份可以是自己的地位更高。
然而赖朝的这个野心随着大姬的病情日益沉重而最终病死而终成画饼。天皇外戚的地位也被赖朝所依赖的源通亲所得到。通亲的后妻连子原本是朝廷的女官，后来又为后鸟羽天皇生下了皇子，也就是后来的土御门天皇。而藤原兼实则在源通亲巧妙策划的政变下最终倒台。
赖朝终于踏上了第二次上洛的归途，在路经美浓的时候，随行的稻毛重成派来急使，说他的妻子得了重病。重成的妻子是北条政子的妹妹，重成和赖朝是姻亲关系。因此赖朝亲自为重成选择了最好的骏马，让他立刻出发。因此重成在三天之后到达的武藏国的领地，两天后，他的妻子病死了，重成当天就剃发出家了。
而事情还远没有结束，三年后，稻毛重成为了纪念他的妻子，于是在相模川上架了一座桥。赖朝因为妻子政子的缘故，参加了桥的落成仪式。在他回归的路上，在赖朝的眼前出现了义经、义仲、范赖、行家等被赖朝所杀的人的影子，连幼小的安德天皇也身着铠甲出现在他面前。赖朝大惊，摔落下马来。半个月后的正治元年（1199年）正月十三日，五十三岁的源赖朝死了。
梶原景时谋反
在赖朝的一周年忌也就是正治二年（1200年）正月二十日，有赖朝的股肱之臣之称的梶原景时被幕府军所杀，一族人全部被处死。
梶原氏和大庭氏一样，是镰仓权五郎的子孙，都是镰仓党的一员。赖朝举兵的时候，大庭景亲受平氏之命率领三千多骑讨伐赖朝，梶原景时也参与了战斗。后来大庭景亲被杀，景时由于曾经放走过战败的赖朝而成为了镰仓御家人。在粗人居多的坂东武士中，景时以他出色的言词能力、歌咏水平而深得赖朝的器重。赖朝死后他担任镰仓二代将军赖家的近侍，权势日渐庞大。
当时赖家十八岁，是镰仓第二代将军，继承了赖朝的独裁体制路线。赖家将自赖朝以来在全国的恩赏地五百全部予以没收，并驳回了一切有关土地的诉讼，计划削弱有力御家人的势力。
当然御家人们是不会保持沉默的。坂东武士们之所以支持赖朝成为了镰仓将军，成立了镰仓幕府，是为了保护他们的土地和领地的支配权。他们也需要镰仓将军为土地的争论做出公正的裁决。然而二代将军这么一来，这些御家人也就觉得镰仓将军失去了存在的必要性了。
对赖家的一些做法感到不安的一些老臣们，在和赖家的母亲北条政子商议后。政子停止了赖家直接裁决诉讼的权力。改成以大江广元为首的御家人代表十三人参加的合议制。这一做法可以说是对镰仓幕府自开幕以来一直实行的赖朝路线的修正，直接体现了坂东武士的利益。
随后，支持赖家独裁的首席近侍梶原景时一派被肃清掉了。景时是赖家的乳母的夫家。这些人还包括比企能员、和越重赖、安达盛长、平贺义信等。前三个人都是赖朝的乳母比企尼的女婿，特别是比企能员，他还是比企尼的养子。此外，他的女儿若狭局是赖家的妻子，生下了儿子一幡。
在赖朝还是流放犯人的时候，母亲家的热田大宫司家和他断绝了关系，只有比企尼资助他生活二十年不断。在赖朝起兵之际，她又派自己的女婿前来报效。而在政子和赖朝结婚后，她和比企尼的关系也非常好。所以，政子生赖家的时候，就选择了比企馆作为住所。又聘请了比企尼的女儿们作了赖家的乳母。实际上赖家是在比企氏的照顾下长大的。所以说他虽说是北条政子所生的孩子，但实际上他对北条家并没有什么感情。
然而，为了抑制赖家的独裁而最先被肃清的，并不是比企氏。而是掌握着实权，权势滔天的梶原景时。
当时有御家人六十六人联名上书至大江广元处状告梶原景时。广元将诉状交给了赖家，经赖家判决结果景时被追放，在回到本领的相模一宫后，他率领一族人向京城而去。但是在途中，经过骏河清见关的时候，和当地的武士发生了战斗，结果一族人都被剿灭。
骏河国守护是政子的父亲，北条时政。据说当时御家人们状告景时，其实是被政子的妹妹阿波局所煽动的。当时她对某个年轻的御家人（一说结城朝光）说，景时要害你。而当时景时的谗言还死了很多御家人的性命。这个年轻的御家人自然是很吃惊，他便去和他相友好的另一位御家人（一说三浦义村）商量，商量的结果就是六十六位御家人联名上书，扳倒了梶原景时。
但是，为什么梶原景时要上洛呢？当时景时被主君赖家所追放，而被源氏的一门众，被源赖朝打压的不成样子的甲斐源氏的头领武田有义所拥立。有义的弟弟石和信光曾到镰仓和景时传达过有义的书信。而景时的上洛，多半也是武田有义所拥立的。景时一党的胜木则宗被幕府逮捕的时候，曾称景时上洛是为了得到朝廷的宣旨。
而朝廷一方也有所举动，当景时起兵的消息传到京都后，后鸟羽上皇的仙洞御所里开始了五坛御修法。从京都来的明了朝廷内部的事情的大江广元和三善康信都对这事表示了怀疑。五坛御修法本来就是朝廷祈求某种事情的一种邪教的修行。这个时期搞这个东西，很自然的就被解释成以祈祷镰仓幕府的灭亡为目的的。
当年承久之乱的征兆，如今又开始呈现了。在赖朝死后，主管幕府在京都的先遣机关的一条能保一族人和属下的武士全被一网打尽。此后，当年促使赖朝举兵的法师文觉也受到了连带，被流放到了佐渡岛。朝廷认为打倒幕府的时机已经来临了。
比企之乱
建仁二年（1202年）七月，镰仓二代源赖家受封从二位征夷大将军。这已经是赖朝死后第四年了。赖朝死后，赖家担任了左中将，继承了前将军的遗产，但是没有马上补任征夷大将军。翌年十月，转任从三位左卫门督。这一次终于就任了征夷大将军。这样一来就否定了关于一开设幕府则必定马上就任征夷大将军的说法。
二代将军赖家的攻守形式顿时逆转了。当时景时倒台的幕后，隐隐有北条时政的影子，教唆某个年轻御家人的阿波局是政子的妹妹，也就是时政的女儿。梶原景时一族的死地骏河国的守护就是时政。不过在九条兼实的日记《玉叶》里，提到过被众人所憎恶的景时，其实是被那些，支持赖家弟弟千幡的，人们所害死的。
这个千幡的乳母就是阿波局，她的丈夫阿野全成是源义经的同母兄弟，幼名今若，原来是洛外醍醐寺的僧人。后来赖朝举兵的时候他来到了下总鹫沼投奔了赖朝。后来还俗，娶了政子的妹妹阿波局为妻。虽然在兄弟的权力斗争中保住了性命，但是由于是千幡乳母的夫家，于是便给他带来了灾祸。
将军赖家开始怀疑支持弟弟的北条一族以及乳母夫家的阿野全成有谋反的企图，而逮捕了他。逃到姐姐政子处的阿波局向赖家要求放回全成，但被拒绝。于是全成被移交给了下野的八田知家，一个月后被诛杀。至此，赖朝的兄弟们全部都从历史的舞台上消失了。
危机直接摆在了支持千幡的北条氏的面前。
这个时候，赖家突然得了重病，建仁三年（1203年）八月末，赖家病危。在关于继承人的问题上，赖家将关东二十八国的守护职交给了六岁的嫡子一幡，而将关西三十八国的守护职交给了十岁的弟弟千幡。
然而，一幡作为将军的后继者，理应获得全部的领地，这样的分配使得一幡的外祖父比企能员很不满。于是他和病床上的赖家会面，商讨征伐北条氏的计划。兵力的集结使得在镰仓的双方的武士们骚动起来。于是，政子和父亲北条时政进行了一次密谈，时政决定先下手，以祈祷将军病情康复为由，将比企能员骗了出来。能员不知是计，于是没有携带武器，仅带着数名手下来到了北条的宅第，于是被当场刺杀。而北条时政随即带人包围了比企氏的住所，将比企一族和若狭局连同一幡母子全部烧死。
这些来龙去脉都是记录在北条氏所编撰的《吾妻镜》中的。而京都的慈园和尚所写的《愚管抄》中却有不同的记载。里面说赖家因为重病不愈，于是决定出家。而将后事都托付给了儿子一幡。而不甘居于比企氏之下的北条时政暗杀了比企能员，将病重的赖家以往别处安置，同时派兵追杀一幡，但是一幡被母亲抱着逃走了。于是北条时政就杀死了比企全族。而后来赖家奇迹般的恢复了健康，听说此后大为光火。于是政子就将他软禁在伊豆的修禅寺中。十一月，一幡被捉住杀死。而翌年七月，赖家也在伊豆的山里结束了二十三岁的生命。《吾妻镜》里并没有记载赖家的死因，传说赖家是在洗澡的时候被刺客所杀死的。
比企这件事是对二代将军赖家独裁路线的否定。表面上是支持赖家·一幡父子的比企一族和支持赖家弟弟千幡的北条一族的权力斗争。而事实上却是北条时政一个人的阴谋。因为是镰仓御家人对赖家的独裁都不是持欢迎态度的。北条时政凭借着自己对镰仓御家人的了解，做出了软禁赖家的举动。
畠山事件
在赖家出家后，在北条时政的支持下，赖家的弟弟千幡成为了镰仓的新主人，并补任征夷大将军。同时后鸟羽院为他赐名“实朝”。镰仓幕府第三代征夷大将军源实朝就此诞生了。
作为外祖父的北条时政很自然的就作了十二岁的将军的太傅。同时在乌帽子亲武藏守平贺义信的主持下元服了。虽然元服了，然而并未选妻，最初的候补者是足利义兼的女儿，也就是他的表妹。但是实朝希望要京都的公主。于是时政的后妻牧之方也就走到了历史的前台。
牧之方出自骏河国，是平清盛的弟弟赖盛领地上的豪族的人。由于和京都有一定的关联，所以她和时政所生的女儿都嫁给了京都的贵族们。在她的斡旋下，藤原坊门信清家的女儿成为了实朝的妻子。这个女孩子的姐姐进了后鸟羽院的后宫，所以实际上实朝和后鸟羽院成了义兄弟了。
和京都进行交涉的人是牧之方的女婿，武藏守平贺义信的儿子平贺朝雅。在前往京都求婚的队伍中，有着牧之方最喜欢的儿子北条政范，然而不幸的是，政范半路突然的了重病，还没有到达京都就病死了。随后坊门藤原家的新娘平安抵达了镰仓，在京都的公卿们看来，将公家的女儿嫁给武家栋梁等于是送给夷狄的人质了。
新娘抵达镰仓后，牧之方忍住丧子之痛，和北条时政一起出席并实际操办了实朝的婚礼。而由时政原配所生的儿子义时·时房和乳母阿波局没有出席。
随后，牧之方开始为爱子政范的死而复仇了。元久二年（1205年）她将目标对准了畠山重忠的儿子畠山重保。重保和政范同是前往京都求婚队伍的成员。途中双方可能关系不睦。在政范死后，他又在酒席上和平贺朝雅发生了大争吵。回到镰仓后畠山父子双双返回了武藏。
平贺氏是甲斐源氏的一支，深得赖朝的喜爱。自义信以来，都以武藏守的身份主持政务。而畠山是武藏国内的本地豪族，和北条氏一样是秩父平氏流的嫡系后裔。是武藏国内数一数二的强力武士团。所以畠山氏和平贺氏由于这层关系，自然不可避免的会发生一些利害冲突。
而畠山重保和平贺朝雅在酒席上争吵之不过是家族矛盾的延长罢了。另一方面，平贺朝雅是牧之方的女婿，而畠山重保的父亲畠山重忠的妻子，则是北条政子的妹妹，是时政前妻的孩子。
为了将畠山氏的势力赶出镰仓，牧之方起用了同为秩父平氏一族的重忠的表兄稻毛重成，重成的妻子也是政子的妹妹，他因为妻子的死原来已经出家。但是他抱着对嫡流畠山家家督的野心，而被时政和牧之方利用了。
时政将计划公布给了前妻一方的义时·时房一派，他们激烈的反对。然而时政依然强硬的继续自己的计划，首先派遣三浦义村暗杀了滞留在镰仓的畠山重保。另一方面，畠山重忠率领一百多人前往镰仓救重保。另一方面，北条义时在牧之方“重保谋反”的强调和北条时政的死命令下，只得率领数万人的大军在武藏国二俣川（横浜市）和畠山军展开激战，击杀畠山重忠，畠山一族被灭。
后来，畠山重忠的妻子，也就是政子的妹妹改嫁给了足利义兼的长子义纯，延续了畠山家的家名。而由三子义氏继承了足利家。而这个义氏的妹妹，正是当年要嫁给实朝未成的那个人。
在时政和牧之方灭掉畠山一族后，事情还远未结束。归还镰仓的义时向父亲报告说，畠山重忠仅以百十人应战，可见并无谋反之心。事情的起因完全是因为稻毛重成的*计所至。于是又联合三浦义村等人，将稻毛一族全部诛杀。
数日后，义时和阿波局商议，认为将实朝放在时政那里非常危险，应该把他弄出来，留在政子的身边为上。于是就向时政夫妇宣布，牧之方有谋反嫌疑，欲废掉现任将军实朝，改立甲斐源氏的平贺朝雅为新将军。同时义时驳回了一切申诉。此时支持时政杀掉实朝的御家人，根本一个都没有。
最终，时政和牧之方被勒令前往伊豆隐居。此后的数十年，夫妻二人在伊豆一边体会着义时的辣腕手段，一边过完了孤寂的一生。于是时政一派就这样被一举消灭了。牧之方的娘家的宇都宫赖纲听到消息，慌忙和一族六十余人集体出家，外出逃难去了。而身处京都的平贺朝雅也被义时派人所杀。
终于获得了镰仓实权北条义时就任相模守，而平贺氏灭亡后留下的武藏守则由义时的弟弟时房继任。于是北条氏开始了他们名副其实的“执权”政治。
三代将军源实朝
元久二年（1205年）七月，北条义时就任政所别当，在他的背后则是姐姐北条政子的支持。和性急于权力而招来反感的父亲时政不同。北条义时是以温和的姿态出现，慢慢的着手于确立北条政权。秘密联络大江广元等老臣，逐渐的获得了御家人们的信赖。
相对的，镰仓三代将军实朝，憧憬于京都的文化，喜好蹴鞠、连歌等活动。尤其是喜欢和歌，他师从京都著名和歌巨匠藤原定家学习和歌，并时常召开歌会。于是，擅长和歌的御家人就会受到优待。下野国的有力御家人长沼宗政说：“当代以歌鞠为业，荒废武艺。如此女性化，国家无勇士矣。”对于作为武家栋梁的源氏的将军，大江广元也评价说：“当代将军并无功勋，只是继承了先祖之业而已。”
对于实朝这种倾向，一般说法这是他害怕北条家而逃避现实的一种方法。当时，京都里盛行的传统文化主要就是和歌。而且和歌通常也被用在政治上。历代的天皇大多也有自己的和歌集。这可以说是作为一个君王的必备条件。直到近代才将和歌和政治分离开来。自平安时代以来，随着朝廷的政治权威日益降低，相对而言的，和歌成了王者的象征。
于是对京都文化相当憧憬的实朝开始鼓励和歌。作为以武起家的镰仓幕府而言，随着时间的变化，出现了武艺荒废的情形，这就是实朝追求身份尊贵性的结果。
在实朝身边有一名武士和田义盛，他对源实朝有一种处于信仰上的敬慕之情。和田氏是三浦半岛上的三浦氏的支流，但是和田义盛凭借其威望，压过了嫡流的三浦义村，担任了侍所别当。当时慈园和尚将他称为“三浦的长者”。
随后，和田义盛向实朝表达了担任了上总国的国司的意愿，这也是实朝的愿望。这时候上总国大部分的领土是由上总介平广常所管辖的，寿永二年（1183年）末，平广常被赖朝授命梶原景时所暗杀。而领地也由和田义盛和千叶常秀所共同领有。如果义盛担任了下总国司，那么在和千叶氏的领地支配问题上处于有利的地位。实质上也可以在镰仓御家人里确立和北条氏并列的地位。
然而实朝的努力却没有成功，政子以自赖朝以来无此先例为由否决了。义盛的愿望的落空，大多是出于北条氏的意愿。
三年后的建保元年（1213年）二月，在镰仓甘绳馆的千叶常秀的哥哥千叶成胤的面前出现了信浓国泉小次郎清衡的家臣阿静房安念。他讲出了要拥立前将军赖家的遗子尾张中务丞的养子千寿王举兵的计划，并要求千叶协助他联络反对北条氏的有力御家人。成胤当场就把他捉住并送交幕府。
根据安念的招供，幕府逮捕数十人，后又调查发现，同意举兵的人数有一百多人。这可以说是镰仓幕府开幕以来最大的阴谋事件。而主谋泉亲衡本人，则在抵抗后逃走了。
在谋反人的名单中出现了和田义盛的儿子义直·义重和外甥胤长的名字。义盛闻报慌忙从领地上总赶来，亲自将一族九十八人押到了镰仓，希望用自己的所有功劳来换取他们的性命。
然而幕府以义盛外甥胤长是主谋而未将他赦免，并当着一族人的面把他流放到了陆奥。义盛抗辩未果，愤然离去。这下，义盛也就慢慢的陷入了北条义时所设下的陷阱里。
和田之战
自镰仓幕府开幕以来，经过了无数次权力斗争和倾轧，最后留下来的两大家族北条氏和三浦一族的最后对决开始了。和田义盛率领一族人向盟主三浦义村献上了誓书，并求到了妻子一方的武藏七党之一的横山氏的援军。但是不甘总居于和田义盛之下的三浦义村出卖了和田义盛，将他要举兵的消息报告给了北条义时。
和田见已经没有退路，于是提前率领七个儿子和一族共一百五十骑举兵。和田义盛是侍所别当，自然也有许多御家人参加了他这一方。而诸如在富士裾野事件中失势的大场一族，被灭的梶原景时的遗臣，以及对北条体制不满的一些人也加入了和田一方。
和田的军队直攻大藏御所，御所瞬间被和田军所放的火烧毁。而政子和实朝则在义时和大江广元的保护下避难去了。北条一方在义时的嫡子北条泰时的指挥下，严防和田军，战斗持续到了晚上。
翌日早晨，和田军渐显疲态，而武藏国横山氏的援军又到了。于是北条氏召集了周边的御家人，逐渐压倒了和田军。经过两天的激战，自和田义盛以下全部军队战死。相比起比企之乱两个小时就结束，和田之战的规模要大很多。和田义盛的嫡子常盛和母亲娘家的横山时兼一族的古郡保忠，兄弟一起逃到了甲斐国波加利庄，在那里自杀。
战斗的结果，和田一族全族灭亡。而派遣援军的横山党也被剿灭。于是三浦一族的实权就落到了三浦义村的手里。因为义村在和田的问题上的背叛行为，于是被其他御家人骂作：“咬朋友的三浦狗”。
和田死后，北条义时兼任了原来由和田义盛担任的侍所别当一职。更加加强了北条氏的职权体制。
此时，将军实朝继续鼓励蹴鞠和和歌。另一方面，又在协助铸造了东大寺大佛的中国人，陈和卿的建议下，建造巨大的唐船，想渡海到中国去。结果如此巨大的大船，造好后却无法推下水，结果就这么在海边腐朽烂掉了。
同时，实朝继续着自己的“猎官运动”，建保四年权中纳言·左近中将。建保六年权大纳言兼左大将、内大臣。同年末升任右大臣。藤原摄关家的子弟也没有过这样速度的升进。对京都的内情很了解的大江广元曾经劝谏过实朝官位低不容易引来危险。但实朝并未采纳。而后鸟羽上皇和朝廷则是想借助实朝和自己身份不相称的高官位来找借口打压。而实朝并没有意识到这一点。
随后实朝得到了自己和京都的公主的孩子。母亲政子前往熊野进行参诣，和后鸟羽上皇的乳母藤原兼子会面，得到了把上皇的皇子迎入坂东的承诺。可以看来北条氏已经有了用皇族将军来代替源氏血脉的想法了。但是多数御家人恐怕不会承认由皇族将军来取代源氏将军的现实。
暗杀实朝
在和田义盛死后，在实朝身边的人换成了政所别当之一，从京都来的源仲章。这个源仲章因为收集了很多书籍而被人称为“百家九流”皆通的人物。一方面他指挥在京都的御家人追讨河野全成的儿子。另一方面他也往来于京都和镰仓之间，担任实朝的伴读和教他学问。
每一次仲章离开镰仓前往京都，都带着连接朝廷的重要使命。在为实朝积极的为获得官位而奔走以外，也为自己获得了一些利益。他被任命为后鸟羽上皇的皇子顺德天皇的侍读。
像源仲章这样幕府和朝廷两头讨好的状况，虽然可以保持实朝和后鸟羽上皇之间的关系的圆满，但是这样子却被镰仓御家人们认为幕府是上皇权力的从属，遭来了不少的反对。
事实上，将军实朝确实有从属于上皇权力的迹象。后鸟羽上皇曾经下过院宣，要幕府将任命的院庄园的地头改易。这个时候的实朝一再退让。对于御家人们而言，镰仓将军如果不能保护他们所获得的地头权力，那么也就没有什么存在意义了。
承久元年（1219年）正月二十七日夜，茫茫大雪之中。在鹤冈八幡宫刚刚进行完右大臣就任仪式的实朝，在返回途中被鹤冈八幡宫别当公晓所暗杀。当时实朝二十八岁，公晓二十岁。
公晓是前将军赖家的儿子，母亲是镇西八郎为朝的孙子加茂重长的女儿。公晓自幼受到政子的喜爱，虽然是出家之身，依然被任命为鹤冈八幡宫的别当。他元服后，被政子安排作了实朝的养子，他的乳母夫家是三浦义村。
当时公晓高喊“为父亲赖家报仇！”在实朝想要逃走之际，他踩住实朝衣服的下摆，对着实朝当头就是一刀。随后对着倒地的实朝又刺了一刀。袭击实朝队伍的还有其他三四名僧人，实朝左右的人都受了伤。手持火把领头的源仲章也被当场杀死。
在队伍中带头的仲章被公晓所杀死，被认为是北条义时的阴谋。慈园在《愚管抄》里记载：“在仪式开始之前，义时突然自言身体不适，而将任务交给了仲章，自己却回自己家去了。”
而在公晓这一举动的背后却可以看到三浦义村的影子。当时公晓和义村见面的时候，公晓口称：“我乃东国的大将军，快来迎接！”而后义村亲自出来迎接，并派使者通知了北条义时。
在实朝死后，义时下令义村诛杀公晓。义村派遣手下的勇士长尾定景，在公晓前往义村宅邸的途中将他杀死。
在将军源实朝就任右大臣仪式之前，义时借故逃走，而作为乳母夫家的三浦义村根本没有参加。所以关于这次暴动的主谋，大多猜测成三浦义村或是北条义时。主要是因为实朝逐渐倾向朝廷一方，对于御家人们来说已经失去了存在的必要。年轻的公晓只不过是被利用了而已。而诛杀公晓的长尾定景则是被灭掉的大场·梶原氏的遗臣。
说起来长尾氏和鹤冈八幡宫的缘分很深，这个长尾氏后来成了室町幕府关东管领上杉氏的执事，到了景虎的时代成了名震天下的战国大名。景虎后来到了鹤冈八幡宫就任关东管领，改名上杉谦信。不知道他是否知道他的先祖在这里所作的事情呢？
总之，源实朝死了，然而他的头被公晓割去不知所终。据《吾妻镜》的记载，实朝的尸体埋葬的时候只得用头发代替头颅。据说是在神奈川县秦野市的金刚寺，三浦义村所派遣去诛杀公晓的刺客之一，武常晴得到了实朝的头。后来被和三浦氏不睦的波多野忠纲埋在了这里，成为了实朝的头冢。武常晴这个人在历史中没有什么记载。
襁褓将军选定
实朝死后半个月，赖朝的弟弟，被赖家所杀的阿野全成的遗子时元在骏河国举兵。时元的目的是为了得到朝廷的旨意而成为坂东的管领，而进一步成为目前呈空白状态的镰仓将军。义时派遣侍所所司带人前去讨伐，但是大败而回。因此幕府目前的要务则是要选定下期将军。
此前北条政子为了得到后鸟羽上皇将皇子送到坂东的承诺，而派政所执事二阶堂行道前往交涉。随后，上皇又派人来为实朝吊丧。在吊唁结束后，上皇提出了自己的要求。
首先是免掉摄津两庄园的地头的职位。在这之前，上皇也曾提出过这要求，而因为实朝的暗杀而事态发生了变化。如今上皇借着幕府需要迎入一个皇子的机会，提出了这样的交换条件。
执权北条义时为难了，如果同意了上皇的要求，免除了两地头的职务。万一下次上皇再次提出这类要求，那么镰仓幕府无疑就权威扫地了。义时很明白这正是后鸟羽上皇想从内部颠覆镰仓幕府的计谋。
结果迎入皇子作下任将军的计划只得搁浅了。然而上京交涉的二阶堂行道，返回镰仓的时候，却带回了赖家的遗子，在仁和寺出家的禅晓。这个禅晓是当年和田之乱的时候，信浓的泉亲衡所支持的千寿王的亲弟弟，母亲是一品房宽昌的女儿。当时这个女人已经改嫁三浦义村的弟弟胤义。如果禅晓成为了镰仓将军，将会对三浦氏十分有利。
北条义时自然无法接受这样的情形，于是他派自己的弟弟时房带领一千人上京，再次展开交涉。结果，藤原摄关家的右大臣九条道家的儿子三寅成为了镰仓的继承人。这个时候三寅才刚刚两岁，被称作襁褓将军。随后就该轮到尼将军政子登场的时候了。
三寅被北条时房抱回了镰仓，这时候，京都发生了一件事。禁内的守护源赖茂，被拥护后鸟羽上皇的西国武士所杀死。这个赖茂是当年拥立以仁王起兵，在宇治桥败死的三位源赖政的孙子。上皇诛杀赖茂的理由是他有对将军谋反的企图。而事实上，应该说是后鸟羽上皇想对幕府动手的企图被赖茂知晓后，杀他灭口而已。
承久之乱
后鸟羽天皇，是西逃的安德天皇的弟弟四宫亲王，后来继后白河法皇的位置登基即位。法皇死后，实权落入了打败关白九条兼实的土御门天皇的外叔父的源通亲的手里。在这期间，后鸟羽天皇擅长和歌，并且个人编撰了《新古今和歌集》。此外，他还精通蹴鞠·管弦·围棋·双六等。
而相对的，后鸟羽天皇还是十八般武艺样样精通，他喜欢相扑·游泳·流镝马等，还经常外出狩猎。而且他很喜欢收集刀剑，在御所内设有锻冶工房。他也时常自己前往锻造，则将这种“天皇锻造”的刀赏给一些亲近的武士。他也喜欢用有菊花纹饰的刀鞘来装饰自己的刀。这就是皇室“菊花御纹”的起源。和作为武家的源实朝的爱好相对比，他们的立场完全不同。
建仁二年（1202年）源通亲暴死，通亲一派一下子就倒台了。承元四年（1210年）十六岁的土御门天皇退位，改由藤原氏之女生的顺德天皇即位，采取强力的独裁政策。在以前院亲卫队的北国武士里，编组了一些西国武士。而西国武士袭击禁宫守护源赖茂的事件，只不过是小试牛刀而已。
由于后鸟羽天皇在和歌上和源实朝的关系，最初并不是走反幕的路线。在慈园看来，最初朝廷处理和幕府的关系是走的协调路线。但是在承元元年（1207年）在白河御所建立了最盛四天王院，对关东进行一些活动。这个最盛四天王院的寺务主管，就是原来担任京都守护，作为幕府的窗口的一条能保的儿子二位法印尊长。随后，随着将军源实朝的死讯传来，后鸟羽院的心情不能平静了，承久三年（1221年）五月，在实朝的忌日上他发布了讨幕的宣言，以流镝马比赛的名义召集了畿内近郊的武士，外加又动员比睿山和熊野的寺社势力。
除了先前的一条·坊门家以外，还有赖朝的母亲家热田大宫司家，源氏一族的大内氏，因为比企之乱而受到牵连的相模粕屋一族，在和田之乱幸免于难的和田朝盛。以及在北条政权的树立过程中倒台的一些人。而且三浦义村的弟弟胤义也加入了后鸟羽一方，因为北条义时之前因为害怕身上流着源氏嫡系血液的赖家的遗子禅晓，会为自己的计划带来危险，于是在一个月之前命令三浦胤义在京都的东山将他杀死。三浦胤义深恨之，于是投向了后鸟羽方。
当然，也有接到了御旨而不接受的御家人。比如妹妹是执权北条义时后妻的京都守护伊贺光季。光季收到上皇的使者的御旨后，立刻向镰仓派出使者报告，而自己也觉悟必有一战。果然翌日后鸟羽方八百人包围了光季的宅邸，光季父子一下一族二十余人奋战之后，自焚而死。伊贺光季的使者抵达了镰仓，向坂东的御家人们宣布了倒幕的御旨。尼将军政子走上前台，发表了历史上有名的演说。向坂东各御家人说，现在是他们报答自源赖朝以来，镰仓三代将军的大恩的时候了。政子的演说，团结了坂东各御家人们的心，加强了他们对幕府的忠诚。当时和北条义时在暗地里进行权力斗争的三浦义村，这个时候也捐弃前嫌，和北条义时携起手来，而放弃了在后鸟羽一方的弟弟胤义。
这天傍晚，召开了作战会议。但是由于坂东武士们不敢违背院宣作战。所以主张进行消极的迎击战的占据了大多数。然而出人意料的是，站出来反对的却是一介文官的大江广元。熟知朝廷各事的大江广元主张直接出击。与此同时，面对院宣，动摇的坂东武士们步步后退。
最终，会议断然做出，决定出击，发出远江·信浓以东十五国的总动员令。兵分东海、东山、北陆三路，由执权北条义时的长子北条泰时所率领，直奔京都而去。东国和西国的这一次正面冲突，在后鸟羽院发出院宣一个月后，以西国的全面败北而告终。
西国武士们焚烧了沿途的民屋仓皇逃走，后鸟羽院回到御所后禁闭大门不出。随后宣布院宣取消。推说这次倒幕计划都是来源于某个谋臣，发出追讨该谋臣的旨意后，向幕府表示自己毫无责任。
面对后鸟羽院的表示，幕府的处理是严酷的。后鸟羽被流放到隐岐，顺德被流放到佐渡。对倒幕计划一无所知的土御门被送去了土佐。后鸟羽的皇子六条宫和冷泉宫被流放到但马·备前国。四月方才即位，在位仅七十余日的仲恭天皇被废，改立茂仁亲王为后崛川天皇。各参与倒幕的公卿们大都被处以流配、免职、禁闭等处分，而参与的武士则大半被处以斩刑。这是历史上少有的由幕府介入皇位废立和流放三上皇的情况。
竹御所和宫将军
承久之乱三年后，动乱的主谋之一，在动乱后逃跑的二位法印尊长被人密告而被逮捕。在他自杀前被送到了六波罗探题。他当时在说了一些有关义时的奇怪的话后，自动要求被斩首。
在元仁元年（1224年）六月十三日，执权北条义时突然死了，关于死因，有很多种说法。
不过总之，义时死后，选出执权这个职位的继承者才是当务之急。大家都支持义时的嫡子，六波罗探题北条泰时。泰时接到报告后立刻赶回镰仓，然而，他没有想到的是，一场阴谋正在等着他。
义时的后妻伊贺局和她的哥哥光宗密谋，想让自己的儿子政村成为执权，而让女婿一条实雅做将军。伊贺光宗和伊贺局是在承久之乱里面对后鸟羽的军队奋战而死的伊贺光季的兄妹，而一条实雅是二位法印尊长的亲弟弟。按照前面提到的尊长的招供，假设伊贺局毒杀了丈夫义时。作为尊长的立场，这个秘密他肯定是知道的，而且也有可能是参与者之一。
但是，伊贺氏的这个阴谋的失策之处就是联络了三浦义村。尼将军北条政子亲自出动，说服了义村，阴谋最终破产。伊贺局、伊贺光宗、一条实雅三人被流放，而北条泰时成为了执权。
执权北条义时之所以可以将权柄牢牢地掌握在手里，和他的姐姐尼将军政子在背后的支持是分不开的。作为赖朝的正室，赖家·实朝的母亲，她在维持已故赖朝的权威和统合御家人方面有着自己独特的魅力。翌年嘉禄元年(1225年)七月，北条政子病死。执权泰时一下子失去了管理御家人们的权威。
这一年十二月，襁褓将军三寅元服，正式改名为源赖经。翌年正月，就任征夷大将军。为了维护镰仓将军的权威，必须再次引入赖朝的血脉，于是赖经娶了二代将军赖家的女儿竹御所为妻。
竹御所大名是鞠子，母亲是比企能员的女儿，她生于赖家被软禁于伊豆的建仁三年（1203年）。这一年，发生了比企之乱。而父亲赖家则在第二年被杀于伊豆。竹御所小时候都是由政子抚养长大的。十四岁时，成为了年长她十岁的实朝夫人的养子。政子死的时候，她主持了葬礼和佛事，和亲生孩子一样，为政子服了一年的丧。三寅元服以后，她成了三寅的正室。那一年，赖经十三岁，而竹御所已经二十八岁了。
镰仓法印贞晓
宽喜三年（1231年）二月，镰仓法印这个名字被京都的贵族们所知晓了。赖朝的庶子贞晓在高野山病死，时年四十六岁。他是赖朝一系最后的男子了。母亲是大进局，是下级贵族藤原时长的女儿。时长担任常陆介时，她在镰仓怀了赖朝的孩子，由于害怕遭来赖朝的正室政子的嫉恨，于是将产所放在了长门景远的家里。母子后来由景远的儿子景国照顾，在政子不注意的状况下，悄悄的生活着。
贞晓七岁的时候，他的事情被政子所得知，为了躲避政子的愤怒，赖朝把他们母子二人送到了伊势国，而后又到了京都。又让贞晓进入了弥勒寺法印隆晓（赖朝的妹夫一条能保
的养子）的仁和寺里为僧。在隆晓处努力修行后，他为后白河的皇子道法法亲王进行了穿法灌顶仪式，因此得到了胜宝·华藏两院，成为了仁和寺的门主，在高野山静静的看着在坂东为了将军的座位而发生流血和争斗。
承久之乱两年后，在政子的请求下，贞晓在高野山内建立了寂静院，以及供奉着源氏三代将军的五轮塔和阿弥陀堂。在堂里保存着赖朝的头发。当初因为政子的嫉妒而被迫离开镰仓的贞晓，这时候已经成为了为源氏三代安魂的祭司了。
随着贞晓的死，赖朝一族的男子全部死去了。这个时候，和赖朝有血缘关系的仅有将军赖经的正室竹御所了。然而她在三年后三十二岁的时候，因为难产而死。自此，赖朝的子孙全部断绝，没有一个人留下来。
竹御所死去的消息在四天后传到了京都，在京的御家人们陷入了大混乱。六波罗探题北条重时连忙赶回镰仓。藤原定家在日记中记下：“赖朝的子孙全部灭绝了，这是他当年杀尽有平氏血统的所有人的报应阿。”
赖朝的后裔
在竹御所死的时候，在《吾妻镜》里记载着有一个女孩子为她服丧。但是并没有记录下她的名字，或者说这只是一个传说而已。
然而传说并没有结束。幕末的时候，萨摩藩接近幕臣弹佐卫门，希望得到他的帮助，理由是他们都是源赖朝的后代。这种说法的来源于镰仓二代将军的乳母之一的比企能员的妹妹丹后内侍，传说她和赖朝生下过孩子，因为逃避政子的怒气而送到了西国。后来这个孩子起名忠久，担任了岛津庄的地头，是岛津氏的祖先。然而，根据岛津氏的系谱，这种说法其实是不可靠的。
在《吾妻镜》里由另一种说法，那就是丹后内侍带着这个孩子嫁给了安达盛长，成为了赖家的乳母。于是就猜测，安达盛长的儿子景盛可能就是赖朝的后裔。然而在弘安八年（1225年）的霜月骚动中，安达一族被北条氏所灭。
以后的镰仓幕府
赖朝的子孙在坂东扎下根来，历经三代。最初源赖朝作为守护王权的草薙剑的化身和王权的代理人来到坂东。统一了由当地中小武士团割据的坂东。成为了坂东的王者，同时也为了将这种王权永远的制度化而努力。二代，三代，然而，坂东这个地方终究不接受外来的人作为他们的王。这样也就促进了源赖朝的子孙灭绝的过程。但是说到底，坂东的武士们，打心底里就不喜欢京都的王权。
赖朝的血统灭绝之后，镰仓再次向京都寻求将军的人选。换言之，是想再要一个王权的代理人。执权北条氏大权在握，将军只不过是装饰品而已。自从源氏灭亡之后，北条氏向朝廷要来了摄关家的子弟做将军。这样的政权形式有点类似于京都的摄关政治，天皇也是作为一种装饰物而存在的。坂东的镰仓幕府和西国的朝廷实质上是同一类的政权，西国政权握在摄关和法皇手里，坂东政权握在执权北条氏手里。
坂东自平将门自称“新皇”以来，一直都想作为一个独立国家和西国平起平坐。这个时候，朝廷、幕府和寺社势力都是被称为权门体制，幕府也是权门之一，换言之，日本列岛其实是处于权力分裂的状态下的。
执权北条泰时为首的领导集团，视京都政权如无物。制定了作为武家政权法规的《御成败式目》，作为以后武家政权法律的样本。坂东的武家本来就是以当地的狩猎民发展过来的，他们四处打猎为生。形成武家后，渐渐以耕田为主，为了保护自己的土地不惜使用武力。这些都体现了狩猎民自然的野性。
赖朝担任征夷大将军最初的行动，就是在富士的裾野举行大规模的狩猎活动，这不仅是一种军事训练，也是有政治上的意图。像这样遵循一定礼仪的狩猎活动，是为了唤醒武家狩猎民原始野性的一种仪式。
自镰仓二代、三代继承以后，狩猎民的原始野性消失殆尽。而残酷的权利斗争中的血沫横飞，正如狩猎过程中的鲜血飞溅一般。而最后，随着御成败式目的制定，坂东最终建立了一个和京都的律令政权相同构造的政权。
镰仓政权的成立，是历史上的一条分割线。一般认为，赖朝建立镰仓幕府，是古代史和近代史的分割线。赖朝的镰仓政权，并不是单纯的复兴西国的古代政权。随着承久之乱的结束，西国政权呈毁灭状态，于是古代史就到这里结束了。
古代的终焉
仁治三年（1242年）六月，执权北条泰时病重。儿子时氏很早就去世了，辅佐他的叔父时房两年前也死了。在把执权的的位置传给了年仅二十岁的孙子经时以后一个月，北条泰时以六十岁的年龄病死。
年轻的经时继承执权的时候，周围的状况很不稳定。当年从京都迎来的襁褓将军赖经，经过了二十多年的岁月已经成长为青年了。宽元二年（1244年），赖经辞去了将军职务，由六岁的儿子赖嗣继任将军。赖经这个将军虽然是装饰品，然而他长时间担任镰仓将军，自然而然的也就成为了一股不可小看的政治势力，北条执权政权出现了一丝危险的讯号。虽然赖经已经辞职引退，但是在幕府里依然保持着影响力。
翌年春，执权经时突然的了重病，一下子就陷入了病危状态。宽元四年（1246年）三月，经时将执权位置让给了弟弟时赖后，二十三岁时病死。这么年轻就死去，他的死因自然引来了多种猜测。
年仅二十岁的时赖一即位就展开了和前将军赖经的夺权行动。首先罢免了叔父名越光时一族，逼的光时和弟弟时幸于五月二十五日出家，时幸数日后自杀。评定众中的千野秀胤一派和光时派同时被罢免。而这次阴谋的中心前将军赖经被押着送回了京都。
到了宝治元年（1247年），时赖利用谋略灭掉了在御家人中最有势力的三浦氏。三浦泰村因为凭借着和先代执权北条泰时的姻亲关系而得到了时赖的信赖。但是泰村的弟弟光村在送赖经入京的时候，曾说了愿意侍奉赖经的话。面对三浦氏这种不稳的举动，时赖命令和北条氏有姻亲关系的安达氏为先锋，率人攻入三浦氏的宅邸，将这里付之一炬。三浦氏族人固守源赖朝的墓地法华堂，和攻入了军兵激战后全部被歼灭。自三浦泰村以下战死·自杀的有五百人。翌日，上总国的千叶秀胤一族也被全部剿灭。
将军赖嗣在镰仓数年后，建长三年（1251年）年末，与和赖经·赖嗣父子有关系的千叶氏有关的一些人发动了叛乱，结果赖嗣受到牵连，被护送回了京都。九条家被后嵯峨天皇罢免，九条道家因受不了这个打击而病死。
翌年四月，后嵯峨上皇的嫡子宗尊亲王被迎往镰仓成为了新的将军，自源氏三代灭亡以后，镰仓所企盼的亲王将军终于诞生了。镰仓政权进入了北条得宗专制体制时代。
和西国政权相同构造的北条政权，在强制的专制体制下得到了强化。但是随着秩序和价值观的逐渐崩溃和再建立，古代的价值观已经完全消失，专制体制已经成为了主流。
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